Protein–RNA interactions for Protein: P61969

Lmo4, LIM domain transcription factor LMO4, mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo4P61969 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lmo4P61969 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lmo4P61969 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lmo4P61969 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lmo4P61969 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lmo4P61969 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lmo4P61969 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lmo4P61969 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lmo4P61969 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lmo4P61969 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lmo4P61969 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Lmo4P61969 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lmo4P61969 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lmo4P61969 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lmo4P61969 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lmo4P61969 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Lmo4P61969 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lmo4P61969 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lmo4P61969 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lmo4P61969 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lmo4P61969 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lmo4P61969 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lmo4P61969 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lmo4P61969 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Lmo4P61969 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lmo4P61969 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lmo4P61969 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lmo4P61969 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lmo4P61969 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lmo4P61969 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lmo4P61969 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lmo4P61969 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Lmo4P61969 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Lmo4P61969 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Lmo4P61969 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Lmo4P61969 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Lmo4P61969 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lmo4P61969 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lmo4P61969 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lmo4P61969 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Lmo4P61969 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Lmo4P61969 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lmo4P61969 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lmo4P61969 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Lmo4P61969 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Lmo4P61969 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lmo4P61969 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lmo4P61969 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lmo4P61969 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lmo4P61969 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lmo4P61969 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lmo4P61969 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lmo4P61969 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lmo4P61969 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lmo4P61969 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lmo4P61969 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lmo4P61969 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lmo4P61969 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Lmo4P61969 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lmo4P61969 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lmo4P61969 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lmo4P61969 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lmo4P61969 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lmo4P61969 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lmo4P61969 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lmo4P61969 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lmo4P61969 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lmo4P61969 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lmo4P61969 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lmo4P61969 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lmo4P61969 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lmo4P61969 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lmo4P61969 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lmo4P61969 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lmo4P61969 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lmo4P61969 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Lmo4P61969 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Lmo4P61969 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lmo4P61969 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lmo4P61969 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lmo4P61969 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lmo4P61969 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lmo4P61969 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lmo4P61969 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lmo4P61969 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lmo4P61969 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lmo4P61969 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lmo4P61969 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Lmo4P61969 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lmo4P61969 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lmo4P61969 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lmo4P61969 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lmo4P61969 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lmo4P61969 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lmo4P61969 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lmo4P61969 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lmo4P61969 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lmo4P61969 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lmo4P61969 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lmo4P61969 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms