Protein–RNA interactions for Protein: P61759

Vbp1, Prefoldin subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vbp1P61759 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vbp1P61759 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vbp1P61759 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vbp1P61759 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vbp1P61759 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vbp1P61759 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vbp1P61759 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vbp1P61759 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vbp1P61759 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vbp1P61759 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vbp1P61759 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vbp1P61759 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vbp1P61759 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vbp1P61759 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vbp1P61759 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vbp1P61759 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Vbp1P61759 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Vbp1P61759 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Vbp1P61759 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Vbp1P61759 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Vbp1P61759 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Vbp1P61759 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Vbp1P61759 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Vbp1P61759 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Vbp1P61759 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vbp1P61759 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vbp1P61759 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vbp1P61759 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vbp1P61759 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vbp1P61759 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vbp1P61759 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vbp1P61759 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Vbp1P61759 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vbp1P61759 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vbp1P61759 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vbp1P61759 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vbp1P61759 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vbp1P61759 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vbp1P61759 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vbp1P61759 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vbp1P61759 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vbp1P61759 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Vbp1P61759 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Vbp1P61759 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Vbp1P61759 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Vbp1P61759 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Vbp1P61759 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Vbp1P61759 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Vbp1P61759 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Vbp1P61759 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Vbp1P61759 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Vbp1P61759 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Vbp1P61759 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Vbp1P61759 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Vbp1P61759 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Vbp1P61759 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Vbp1P61759 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Vbp1P61759 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Vbp1P61759 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Vbp1P61759 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Vbp1P61759 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Vbp1P61759 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Vbp1P61759 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Vbp1P61759 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Vbp1P61759 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Vbp1P61759 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Vbp1P61759 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Vbp1P61759 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Vbp1P61759 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Vbp1P61759 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Vbp1P61759 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Vbp1P61759 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Vbp1P61759 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Vbp1P61759 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Vbp1P61759 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Vbp1P61759 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Vbp1P61759 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Vbp1P61759 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Vbp1P61759 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Vbp1P61759 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Vbp1P61759 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Vbp1P61759 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Vbp1P61759 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Vbp1P61759 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Vbp1P61759 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Vbp1P61759 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Vbp1P61759 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Vbp1P61759 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Vbp1P61759 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Vbp1P61759 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Vbp1P61759 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Vbp1P61759 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Vbp1P61759 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Vbp1P61759 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Vbp1P61759 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Vbp1P61759 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Vbp1P61759 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Vbp1P61759 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Vbp1P61759 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Vbp1P61759 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms