Protein–RNA interactions for Protein: P59997

Kdm2a, Lysine-specific demethylase 2A, mousemouse

Predictions only

Length 1,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm2aP59997 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Kdm2aP59997 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC32.98■■■□□ 2.87
Kdm2aP59997 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Kdm2aP59997 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Kdm2aP59997 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Kdm2aP59997 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Kdm2aP59997 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC32.96■■■□□ 2.87
Kdm2aP59997 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Kdm2aP59997 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
Kdm2aP59997 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Kdm2aP59997 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC32.94■■■□□ 2.86
Kdm2aP59997 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
Kdm2aP59997 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Kdm2aP59997 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Kdm2aP59997 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC32.93■■■□□ 2.86
Kdm2aP59997 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Kdm2aP59997 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
Kdm2aP59997 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
Kdm2aP59997 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
Kdm2aP59997 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
Kdm2aP59997 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
Kdm2aP59997 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Kdm2aP59997 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
Kdm2aP59997 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
Kdm2aP59997 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Kdm2aP59997 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
Kdm2aP59997 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
Kdm2aP59997 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Kdm2aP59997 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Kdm2aP59997 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Kdm2aP59997 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Kdm2aP59997 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Kdm2aP59997 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Kdm2aP59997 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Kdm2aP59997 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Kdm2aP59997 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
Kdm2aP59997 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Kdm2aP59997 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC32.85■■■□□ 2.85
Kdm2aP59997 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Kdm2aP59997 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Kdm2aP59997 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Kdm2aP59997 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
Kdm2aP59997 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Kdm2aP59997 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Kdm2aP59997 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.85
Kdm2aP59997 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Kdm2aP59997 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Kdm2aP59997 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Kdm2aP59997 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Kdm2aP59997 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Kdm2aP59997 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Kdm2aP59997 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Kdm2aP59997 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
Kdm2aP59997 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Kdm2aP59997 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
Kdm2aP59997 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
Kdm2aP59997 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Kdm2aP59997 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Kdm2aP59997 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Kdm2aP59997 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Kdm2aP59997 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Kdm2aP59997 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Kdm2aP59997 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Kdm2aP59997 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
Kdm2aP59997 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Kdm2aP59997 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Kdm2aP59997 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
Kdm2aP59997 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Kdm2aP59997 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
Kdm2aP59997 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Kdm2aP59997 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
Kdm2aP59997 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
Kdm2aP59997 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Kdm2aP59997 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Kdm2aP59997 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Kdm2aP59997 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Kdm2aP59997 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Kdm2aP59997 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Kdm2aP59997 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Kdm2aP59997 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Kdm2aP59997 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Kdm2aP59997 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.82
Kdm2aP59997 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Kdm2aP59997 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC32.69■■■□□ 2.82
Kdm2aP59997 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
Kdm2aP59997 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
Kdm2aP59997 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Kdm2aP59997 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
Kdm2aP59997 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Kdm2aP59997 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC32.65■■■□□ 2.82
Kdm2aP59997 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Kdm2aP59997 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Kdm2aP59997 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC32.64■■■□□ 2.82
Kdm2aP59997 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Kdm2aP59997 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Kdm2aP59997 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC32.63■■■□□ 2.81
Kdm2aP59997 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Kdm2aP59997 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Kdm2aP59997 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Kdm2aP59997 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms