Protein–RNA interactions for Protein: P58749

Tm6sf1, Transmembrane 6 superfamily member 1, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm6sf1P58749 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Tm6sf1P58749 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Tm6sf1P58749 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Tm6sf1P58749 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Tm6sf1P58749 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Tm6sf1P58749 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Tm6sf1P58749 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Tm6sf1P58749 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Tm6sf1P58749 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Tm6sf1P58749 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Tm6sf1P58749 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Tm6sf1P58749 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Tm6sf1P58749 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Tm6sf1P58749 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Tm6sf1P58749 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Tm6sf1P58749 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Tm6sf1P58749 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Tm6sf1P58749 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Tm6sf1P58749 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Tm6sf1P58749 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Tm6sf1P58749 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Tm6sf1P58749 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Tm6sf1P58749 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Tm6sf1P58749 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Tm6sf1P58749 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Tm6sf1P58749 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Tm6sf1P58749 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Tm6sf1P58749 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Tm6sf1P58749 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Tm6sf1P58749 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Tm6sf1P58749 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Tm6sf1P58749 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Tm6sf1P58749 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Tm6sf1P58749 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Tm6sf1P58749 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Tm6sf1P58749 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Tm6sf1P58749 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Tm6sf1P58749 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Tm6sf1P58749 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Tm6sf1P58749 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Tm6sf1P58749 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Tm6sf1P58749 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Tm6sf1P58749 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Tm6sf1P58749 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Tm6sf1P58749 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Tm6sf1P58749 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Tm6sf1P58749 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Tm6sf1P58749 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Tm6sf1P58749 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Tm6sf1P58749 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Tm6sf1P58749 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Tm6sf1P58749 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Tm6sf1P58749 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Tm6sf1P58749 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Tm6sf1P58749 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Tm6sf1P58749 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Tm6sf1P58749 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Tm6sf1P58749 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Tm6sf1P58749 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Tm6sf1P58749 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Tm6sf1P58749 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Tm6sf1P58749 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Tm6sf1P58749 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Tm6sf1P58749 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Tm6sf1P58749 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Tm6sf1P58749 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Tm6sf1P58749 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Tm6sf1P58749 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Tm6sf1P58749 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Tm6sf1P58749 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Tm6sf1P58749 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Tm6sf1P58749 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Tm6sf1P58749 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
Tm6sf1P58749 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Tm6sf1P58749 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Tm6sf1P58749 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Tm6sf1P58749 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Tm6sf1P58749 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Tm6sf1P58749 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Tm6sf1P58749 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Tm6sf1P58749 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Tm6sf1P58749 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Tm6sf1P58749 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Tm6sf1P58749 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Tm6sf1P58749 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Tm6sf1P58749 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Tm6sf1P58749 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Tm6sf1P58749 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Tm6sf1P58749 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Tm6sf1P58749 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Tm6sf1P58749 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Tm6sf1P58749 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Tm6sf1P58749 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Tm6sf1P58749 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Tm6sf1P58749 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Tm6sf1P58749 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Tm6sf1P58749 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Tm6sf1P58749 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Tm6sf1P58749 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Tm6sf1P58749 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms