Protein–RNA interactions for Protein: P55097

Ctsk, Cathepsin K, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtskP55097 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CtskP55097 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CtskP55097 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CtskP55097 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CtskP55097 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CtskP55097 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CtskP55097 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CtskP55097 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CtskP55097 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CtskP55097 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CtskP55097 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CtskP55097 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CtskP55097 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CtskP55097 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CtskP55097 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CtskP55097 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CtskP55097 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CtskP55097 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CtskP55097 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CtskP55097 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CtskP55097 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CtskP55097 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CtskP55097 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CtskP55097 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CtskP55097 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CtskP55097 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CtskP55097 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CtskP55097 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CtskP55097 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CtskP55097 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CtskP55097 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CtskP55097 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CtskP55097 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CtskP55097 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CtskP55097 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CtskP55097 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CtskP55097 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CtskP55097 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CtskP55097 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CtskP55097 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CtskP55097 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CtskP55097 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CtskP55097 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CtskP55097 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CtskP55097 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CtskP55097 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CtskP55097 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CtskP55097 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CtskP55097 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CtskP55097 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CtskP55097 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CtskP55097 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CtskP55097 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CtskP55097 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CtskP55097 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CtskP55097 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CtskP55097 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CtskP55097 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CtskP55097 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CtskP55097 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CtskP55097 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CtskP55097 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CtskP55097 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CtskP55097 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CtskP55097 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CtskP55097 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CtskP55097 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CtskP55097 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CtskP55097 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CtskP55097 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CtskP55097 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CtskP55097 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CtskP55097 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CtskP55097 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CtskP55097 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CtskP55097 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CtskP55097 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CtskP55097 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CtskP55097 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CtskP55097 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CtskP55097 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CtskP55097 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CtskP55097 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CtskP55097 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CtskP55097 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CtskP55097 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CtskP55097 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CtskP55097 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CtskP55097 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CtskP55097 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CtskP55097 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CtskP55097 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CtskP55097 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CtskP55097 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CtskP55097 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CtskP55097 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CtskP55097 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CtskP55097 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CtskP55097 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CtskP55097 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.9 ms