Protein–RNA interactions for Protein: P54728

Rad23b, UV excision repair protein RAD23 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23bP54728 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Rad23bP54728 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Rad23bP54728 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Rad23bP54728 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Rad23bP54728 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Rad23bP54728 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Rad23bP54728 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Rad23bP54728 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
Rad23bP54728 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Rad23bP54728 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Rad23bP54728 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Rad23bP54728 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
Rad23bP54728 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Rad23bP54728 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Rad23bP54728 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Rad23bP54728 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Rad23bP54728 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Rad23bP54728 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Rad23bP54728 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Rad23bP54728 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Rad23bP54728 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
Rad23bP54728 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Rad23bP54728 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
Rad23bP54728 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Rad23bP54728 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Rad23bP54728 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Rad23bP54728 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Rad23bP54728 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Rad23bP54728 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Rad23bP54728 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
Rad23bP54728 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Rad23bP54728 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Rad23bP54728 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Rad23bP54728 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Rad23bP54728 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Rad23bP54728 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Rad23bP54728 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Rad23bP54728 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Rad23bP54728 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Rad23bP54728 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Rad23bP54728 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Rad23bP54728 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Rad23bP54728 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Rad23bP54728 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Rad23bP54728 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Rad23bP54728 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Rad23bP54728 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Rad23bP54728 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Rad23bP54728 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Rad23bP54728 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Rad23bP54728 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Rad23bP54728 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Rad23bP54728 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Rad23bP54728 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Rad23bP54728 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Rad23bP54728 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
Rad23bP54728 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
Rad23bP54728 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Rad23bP54728 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
Rad23bP54728 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Rad23bP54728 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Rad23bP54728 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Rad23bP54728 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Rad23bP54728 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Rad23bP54728 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Rad23bP54728 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Rad23bP54728 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Rad23bP54728 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Rad23bP54728 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Rad23bP54728 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Rad23bP54728 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Rad23bP54728 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Rad23bP54728 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Rad23bP54728 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Rad23bP54728 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Rad23bP54728 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Rad23bP54728 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Rad23bP54728 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Rad23bP54728 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Rad23bP54728 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Rad23bP54728 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Rad23bP54728 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Rad23bP54728 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Rad23bP54728 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Rad23bP54728 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Rad23bP54728 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Rad23bP54728 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Rad23bP54728 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Rad23bP54728 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Rad23bP54728 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Rad23bP54728 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Rad23bP54728 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Rad23bP54728 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Rad23bP54728 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Rad23bP54728 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Rad23bP54728 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Rad23bP54728 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Rad23bP54728 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Rad23bP54728 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Rad23bP54728 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 125.6 ms