Protein–RNA interactions for Protein: P48432

Sox2, Transcription factor SOX-2, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox2P48432 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sox2P48432 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sox2P48432 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sox2P48432 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sox2P48432 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sox2P48432 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sox2P48432 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Sox2P48432 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sox2P48432 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sox2P48432 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sox2P48432 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sox2P48432 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sox2P48432 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sox2P48432 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sox2P48432 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sox2P48432 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sox2P48432 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sox2P48432 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sox2P48432 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sox2P48432 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sox2P48432 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sox2P48432 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sox2P48432 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Sox2P48432 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sox2P48432 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sox2P48432 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sox2P48432 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sox2P48432 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sox2P48432 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Sox2P48432 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Sox2P48432 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sox2P48432 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sox2P48432 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Sox2P48432 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Sox2P48432 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sox2P48432 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sox2P48432 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sox2P48432 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sox2P48432 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sox2P48432 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sox2P48432 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sox2P48432 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sox2P48432 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Sox2P48432 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sox2P48432 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sox2P48432 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sox2P48432 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sox2P48432 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sox2P48432 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sox2P48432 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sox2P48432 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sox2P48432 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sox2P48432 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sox2P48432 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sox2P48432 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sox2P48432 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sox2P48432 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sox2P48432 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Sox2P48432 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sox2P48432 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sox2P48432 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sox2P48432 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sox2P48432 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sox2P48432 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sox2P48432 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sox2P48432 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Sox2P48432 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sox2P48432 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sox2P48432 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sox2P48432 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sox2P48432 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sox2P48432 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sox2P48432 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sox2P48432 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sox2P48432 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sox2P48432 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sox2P48432 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Sox2P48432 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Sox2P48432 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sox2P48432 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sox2P48432 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sox2P48432 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Sox2P48432 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sox2P48432 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sox2P48432 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sox2P48432 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sox2P48432 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sox2P48432 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sox2P48432 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sox2P48432 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sox2P48432 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sox2P48432 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Sox2P48432 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sox2P48432 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sox2P48432 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Sox2P48432 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sox2P48432 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sox2P48432 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sox2P48432 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sox2P48432 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms