Protein–RNA interactions for Protein: P48193

Epb41, Protein 4.1, mousemouse

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb41P48193 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Epb41P48193 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Epb41P48193 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Epb41P48193 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Epb41P48193 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Epb41P48193 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Epb41P48193 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Epb41P48193 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Epb41P48193 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Epb41P48193 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Epb41P48193 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Epb41P48193 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Epb41P48193 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Epb41P48193 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Epb41P48193 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Epb41P48193 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Epb41P48193 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Epb41P48193 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Epb41P48193 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Epb41P48193 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Epb41P48193 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Epb41P48193 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Epb41P48193 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Epb41P48193 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Epb41P48193 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Epb41P48193 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Epb41P48193 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Epb41P48193 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Epb41P48193 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Epb41P48193 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Epb41P48193 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Epb41P48193 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Epb41P48193 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Epb41P48193 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Epb41P48193 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Epb41P48193 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Epb41P48193 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Epb41P48193 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Epb41P48193 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Epb41P48193 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Epb41P48193 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Epb41P48193 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Epb41P48193 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Epb41P48193 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Epb41P48193 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Epb41P48193 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Epb41P48193 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Epb41P48193 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Epb41P48193 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Epb41P48193 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Epb41P48193 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Epb41P48193 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Epb41P48193 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Epb41P48193 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Epb41P48193 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Epb41P48193 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Epb41P48193 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Epb41P48193 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Epb41P48193 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Epb41P48193 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Epb41P48193 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Epb41P48193 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Epb41P48193 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Epb41P48193 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Epb41P48193 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Epb41P48193 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Epb41P48193 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Epb41P48193 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Epb41P48193 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Epb41P48193 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Epb41P48193 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Epb41P48193 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Epb41P48193 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Epb41P48193 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Epb41P48193 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Epb41P48193 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Epb41P48193 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Epb41P48193 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Epb41P48193 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Epb41P48193 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Epb41P48193 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Epb41P48193 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Epb41P48193 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Epb41P48193 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Epb41P48193 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Epb41P48193 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Epb41P48193 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Epb41P48193 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Epb41P48193 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Epb41P48193 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Epb41P48193 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Epb41P48193 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Epb41P48193 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Epb41P48193 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Epb41P48193 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Epb41P48193 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Epb41P48193 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Epb41P48193 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Epb41P48193 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Epb41P48193 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61 ms