Protein–RNA interactions for Protein: P47774

Ccr7, C-C chemokine receptor type 7, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr7P47774 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccr7P47774 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccr7P47774 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccr7P47774 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccr7P47774 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccr7P47774 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccr7P47774 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccr7P47774 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccr7P47774 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccr7P47774 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccr7P47774 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccr7P47774 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccr7P47774 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccr7P47774 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccr7P47774 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccr7P47774 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccr7P47774 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccr7P47774 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccr7P47774 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccr7P47774 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccr7P47774 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccr7P47774 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccr7P47774 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccr7P47774 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccr7P47774 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccr7P47774 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccr7P47774 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccr7P47774 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccr7P47774 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccr7P47774 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccr7P47774 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccr7P47774 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccr7P47774 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccr7P47774 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccr7P47774 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccr7P47774 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccr7P47774 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccr7P47774 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccr7P47774 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccr7P47774 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ccr7P47774 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ccr7P47774 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccr7P47774 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccr7P47774 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccr7P47774 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccr7P47774 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccr7P47774 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccr7P47774 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccr7P47774 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccr7P47774 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccr7P47774 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccr7P47774 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccr7P47774 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccr7P47774 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccr7P47774 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccr7P47774 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccr7P47774 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccr7P47774 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccr7P47774 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccr7P47774 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccr7P47774 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccr7P47774 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccr7P47774 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccr7P47774 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccr7P47774 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccr7P47774 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccr7P47774 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccr7P47774 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccr7P47774 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccr7P47774 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccr7P47774 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccr7P47774 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccr7P47774 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccr7P47774 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccr7P47774 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccr7P47774 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccr7P47774 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccr7P47774 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccr7P47774 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccr7P47774 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccr7P47774 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccr7P47774 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccr7P47774 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccr7P47774 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccr7P47774 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccr7P47774 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccr7P47774 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccr7P47774 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccr7P47774 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccr7P47774 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccr7P47774 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccr7P47774 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccr7P47774 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccr7P47774 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccr7P47774 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccr7P47774 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccr7P47774 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccr7P47774 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccr7P47774 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccr7P47774 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms