Protein–RNA interactions for Protein: P46737

Brcc3, Lys-63-specific deubiquitinase BRCC36, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brcc3P46737 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Brcc3P46737 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Brcc3P46737 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Brcc3P46737 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Brcc3P46737 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Brcc3P46737 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Brcc3P46737 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Brcc3P46737 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Brcc3P46737 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Brcc3P46737 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Brcc3P46737 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Brcc3P46737 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Brcc3P46737 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Brcc3P46737 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Brcc3P46737 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Brcc3P46737 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Brcc3P46737 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Brcc3P46737 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Brcc3P46737 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Brcc3P46737 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Brcc3P46737 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Brcc3P46737 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Brcc3P46737 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Brcc3P46737 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Brcc3P46737 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Brcc3P46737 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Brcc3P46737 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Brcc3P46737 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Brcc3P46737 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Brcc3P46737 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Brcc3P46737 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Brcc3P46737 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Brcc3P46737 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Brcc3P46737 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Brcc3P46737 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Brcc3P46737 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Brcc3P46737 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Brcc3P46737 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Brcc3P46737 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Brcc3P46737 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Brcc3P46737 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Brcc3P46737 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Brcc3P46737 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Brcc3P46737 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Brcc3P46737 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Brcc3P46737 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Brcc3P46737 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Brcc3P46737 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Brcc3P46737 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Brcc3P46737 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Brcc3P46737 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Brcc3P46737 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Brcc3P46737 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Brcc3P46737 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Brcc3P46737 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Brcc3P46737 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Brcc3P46737 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Brcc3P46737 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Brcc3P46737 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Brcc3P46737 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Brcc3P46737 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Brcc3P46737 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Brcc3P46737 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Brcc3P46737 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Brcc3P46737 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Brcc3P46737 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Brcc3P46737 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Brcc3P46737 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Brcc3P46737 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Brcc3P46737 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Brcc3P46737 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Brcc3P46737 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Brcc3P46737 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Brcc3P46737 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Brcc3P46737 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Brcc3P46737 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Brcc3P46737 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Brcc3P46737 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Brcc3P46737 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Brcc3P46737 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Brcc3P46737 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Brcc3P46737 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Brcc3P46737 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Brcc3P46737 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Brcc3P46737 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Brcc3P46737 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Brcc3P46737 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Brcc3P46737 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Brcc3P46737 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Brcc3P46737 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Brcc3P46737 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Brcc3P46737 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Brcc3P46737 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Brcc3P46737 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Brcc3P46737 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Brcc3P46737 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Brcc3P46737 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Brcc3P46737 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Brcc3P46737 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Brcc3P46737 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms