Protein–RNA interactions for Protein: P46718

Pdcd2, Programmed cell death protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd2P46718 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pdcd2P46718 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pdcd2P46718 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pdcd2P46718 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pdcd2P46718 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pdcd2P46718 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pdcd2P46718 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pdcd2P46718 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pdcd2P46718 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pdcd2P46718 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pdcd2P46718 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pdcd2P46718 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pdcd2P46718 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pdcd2P46718 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pdcd2P46718 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pdcd2P46718 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pdcd2P46718 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Pdcd2P46718 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Pdcd2P46718 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Pdcd2P46718 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Pdcd2P46718 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pdcd2P46718 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pdcd2P46718 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pdcd2P46718 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pdcd2P46718 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Pdcd2P46718 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pdcd2P46718 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pdcd2P46718 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pdcd2P46718 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pdcd2P46718 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pdcd2P46718 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pdcd2P46718 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pdcd2P46718 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pdcd2P46718 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pdcd2P46718 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pdcd2P46718 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pdcd2P46718 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pdcd2P46718 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Pdcd2P46718 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pdcd2P46718 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pdcd2P46718 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pdcd2P46718 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pdcd2P46718 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pdcd2P46718 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pdcd2P46718 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pdcd2P46718 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Pdcd2P46718 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pdcd2P46718 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Pdcd2P46718 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pdcd2P46718 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pdcd2P46718 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pdcd2P46718 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pdcd2P46718 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pdcd2P46718 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pdcd2P46718 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Pdcd2P46718 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pdcd2P46718 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pdcd2P46718 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pdcd2P46718 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pdcd2P46718 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pdcd2P46718 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pdcd2P46718 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pdcd2P46718 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pdcd2P46718 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pdcd2P46718 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pdcd2P46718 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Pdcd2P46718 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pdcd2P46718 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pdcd2P46718 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pdcd2P46718 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pdcd2P46718 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pdcd2P46718 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pdcd2P46718 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pdcd2P46718 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pdcd2P46718 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pdcd2P46718 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pdcd2P46718 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pdcd2P46718 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pdcd2P46718 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pdcd2P46718 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pdcd2P46718 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pdcd2P46718 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pdcd2P46718 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pdcd2P46718 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pdcd2P46718 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pdcd2P46718 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pdcd2P46718 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Pdcd2P46718 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Pdcd2P46718 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pdcd2P46718 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pdcd2P46718 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pdcd2P46718 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pdcd2P46718 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pdcd2P46718 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pdcd2P46718 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pdcd2P46718 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pdcd2P46718 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pdcd2P46718 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pdcd2P46718 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pdcd2P46718 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms