Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VhlP40338 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VhlP40338 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
VhlP40338 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
VhlP40338 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
VhlP40338 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
VhlP40338 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VhlP40338 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VhlP40338 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
VhlP40338 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VhlP40338 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC19■□□□□ 0.63
VhlP40338 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VhlP40338 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
VhlP40338 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VhlP40338 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VhlP40338 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VhlP40338 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VhlP40338 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VhlP40338 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VhlP40338 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
VhlP40338 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
VhlP40338 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VhlP40338 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
VhlP40338 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
VhlP40338 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VhlP40338 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VhlP40338 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
VhlP40338 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VhlP40338 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VhlP40338 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
VhlP40338 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VhlP40338 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
VhlP40338 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VhlP40338 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VhlP40338 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VhlP40338 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VhlP40338 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VhlP40338 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VhlP40338 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VhlP40338 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VhlP40338 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VhlP40338 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VhlP40338 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VhlP40338 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
VhlP40338 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
VhlP40338 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
VhlP40338 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
VhlP40338 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
VhlP40338 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
VhlP40338 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
VhlP40338 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VhlP40338 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
VhlP40338 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VhlP40338 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
VhlP40338 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
VhlP40338 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VhlP40338 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VhlP40338 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
VhlP40338 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
VhlP40338 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
VhlP40338 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
VhlP40338 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
VhlP40338 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
VhlP40338 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
VhlP40338 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
VhlP40338 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
VhlP40338 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
VhlP40338 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
VhlP40338 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
VhlP40338 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
VhlP40338 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
VhlP40338 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
VhlP40338 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
VhlP40338 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
VhlP40338 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
VhlP40338 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
VhlP40338 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
VhlP40338 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
VhlP40338 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
VhlP40338 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
VhlP40338 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
VhlP40338 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
VhlP40338 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
VhlP40338 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
VhlP40338 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
VhlP40338 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
VhlP40338 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
VhlP40338 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
VhlP40338 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
VhlP40338 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
VhlP40338 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
VhlP40338 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
VhlP40338 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
VhlP40338 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
VhlP40338 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
VhlP40338 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
VhlP40338 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
VhlP40338 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
VhlP40338 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
VhlP40338 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms