Protein–RNA interactions for Protein: P40237

Cd82, CD82 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd82P40237 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cd82P40237 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cd82P40237 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Cd82P40237 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Cd82P40237 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cd82P40237 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cd82P40237 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Cd82P40237 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Cd82P40237 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cd82P40237 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cd82P40237 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Cd82P40237 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Cd82P40237 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cd82P40237 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cd82P40237 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cd82P40237 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cd82P40237 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cd82P40237 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cd82P40237 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cd82P40237 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cd82P40237 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cd82P40237 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cd82P40237 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Cd82P40237 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cd82P40237 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cd82P40237 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cd82P40237 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cd82P40237 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cd82P40237 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cd82P40237 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cd82P40237 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cd82P40237 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cd82P40237 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cd82P40237 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cd82P40237 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cd82P40237 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cd82P40237 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cd82P40237 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cd82P40237 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cd82P40237 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cd82P40237 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cd82P40237 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cd82P40237 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cd82P40237 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cd82P40237 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cd82P40237 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cd82P40237 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cd82P40237 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cd82P40237 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cd82P40237 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cd82P40237 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cd82P40237 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cd82P40237 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cd82P40237 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cd82P40237 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cd82P40237 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cd82P40237 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cd82P40237 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Cd82P40237 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cd82P40237 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cd82P40237 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cd82P40237 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cd82P40237 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cd82P40237 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cd82P40237 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cd82P40237 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Cd82P40237 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cd82P40237 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cd82P40237 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cd82P40237 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cd82P40237 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cd82P40237 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cd82P40237 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cd82P40237 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cd82P40237 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cd82P40237 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cd82P40237 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cd82P40237 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cd82P40237 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cd82P40237 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cd82P40237 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cd82P40237 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cd82P40237 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cd82P40237 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cd82P40237 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cd82P40237 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cd82P40237 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cd82P40237 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cd82P40237 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cd82P40237 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Cd82P40237 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cd82P40237 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cd82P40237 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cd82P40237 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Cd82P40237 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cd82P40237 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cd82P40237 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cd82P40237 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cd82P40237 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cd82P40237 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms