Protein–RNA interactions for Protein: P39039

Mbl1, Mannose-binding protein A, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbl1P39039 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mbl1P39039 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mbl1P39039 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mbl1P39039 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mbl1P39039 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mbl1P39039 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mbl1P39039 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Mbl1P39039 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Mbl1P39039 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mbl1P39039 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mbl1P39039 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mbl1P39039 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mbl1P39039 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mbl1P39039 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mbl1P39039 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mbl1P39039 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mbl1P39039 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mbl1P39039 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mbl1P39039 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mbl1P39039 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mbl1P39039 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mbl1P39039 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mbl1P39039 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mbl1P39039 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mbl1P39039 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mbl1P39039 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Mbl1P39039 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mbl1P39039 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Mbl1P39039 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mbl1P39039 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Mbl1P39039 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Mbl1P39039 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Mbl1P39039 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Mbl1P39039 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Mbl1P39039 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mbl1P39039 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mbl1P39039 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mbl1P39039 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mbl1P39039 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mbl1P39039 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mbl1P39039 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mbl1P39039 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mbl1P39039 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mbl1P39039 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mbl1P39039 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mbl1P39039 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Mbl1P39039 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Mbl1P39039 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mbl1P39039 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mbl1P39039 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mbl1P39039 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mbl1P39039 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mbl1P39039 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mbl1P39039 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mbl1P39039 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mbl1P39039 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mbl1P39039 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mbl1P39039 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mbl1P39039 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mbl1P39039 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mbl1P39039 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mbl1P39039 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Mbl1P39039 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mbl1P39039 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mbl1P39039 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mbl1P39039 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mbl1P39039 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mbl1P39039 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Mbl1P39039 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mbl1P39039 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mbl1P39039 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mbl1P39039 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mbl1P39039 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mbl1P39039 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mbl1P39039 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mbl1P39039 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mbl1P39039 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mbl1P39039 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Mbl1P39039 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mbl1P39039 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mbl1P39039 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mbl1P39039 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mbl1P39039 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Mbl1P39039 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mbl1P39039 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mbl1P39039 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mbl1P39039 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mbl1P39039 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mbl1P39039 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mbl1P39039 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mbl1P39039 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mbl1P39039 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Mbl1P39039 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Mbl1P39039 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Mbl1P39039 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mbl1P39039 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mbl1P39039 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mbl1P39039 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mbl1P39039 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mbl1P39039 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms