Protein–RNA interactions for Protein: P35436

Grin2a, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, mousemouse

Predictions only

Length 1,464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2aP35436 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC38.12■■■■□ 3.69
Grin2aP35436 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
Grin2aP35436 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC38.12■■■■□ 3.69
Grin2aP35436 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
Grin2aP35436 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
Grin2aP35436 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
Grin2aP35436 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
Grin2aP35436 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC38.09■■■■□ 3.69
Grin2aP35436 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
Grin2aP35436 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC38.09■■■■□ 3.69
Grin2aP35436 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC38.09■■■■□ 3.69
Grin2aP35436 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
Grin2aP35436 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC38.08■■■■□ 3.69
Grin2aP35436 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
Grin2aP35436 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
Grin2aP35436 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC38.08■■■■□ 3.69
Grin2aP35436 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC38.08■■■■□ 3.69
Grin2aP35436 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC38.08■■■■□ 3.69
Grin2aP35436 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC38.07■■■■□ 3.69
Grin2aP35436 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC38.07■■■■□ 3.68
Grin2aP35436 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC38.07■■■■□ 3.68
Grin2aP35436 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
Grin2aP35436 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
Grin2aP35436 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
Grin2aP35436 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC38.05■■■■□ 3.68
Grin2aP35436 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC38.03■■■■□ 3.68
Grin2aP35436 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
Grin2aP35436 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
Grin2aP35436 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.01■■■■□ 3.68
Grin2aP35436 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.67
Grin2aP35436 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC38.01■■■■□ 3.67
Grin2aP35436 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC38.01■■■■□ 3.67
Grin2aP35436 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC38.01■■■■□ 3.67
Grin2aP35436 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
Grin2aP35436 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
Grin2aP35436 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
Grin2aP35436 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC37.98■■■■□ 3.67
Grin2aP35436 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
Grin2aP35436 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
Grin2aP35436 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
Grin2aP35436 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
Grin2aP35436 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
Grin2aP35436 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
Grin2aP35436 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC37.94■■■■□ 3.66
Grin2aP35436 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
Grin2aP35436 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
Grin2aP35436 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC37.92■■■■□ 3.66
Grin2aP35436 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
Grin2aP35436 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC37.89■■■■□ 3.66
Grin2aP35436 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.89■■■■□ 3.66
Grin2aP35436 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.66
Grin2aP35436 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
Grin2aP35436 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
Grin2aP35436 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
Grin2aP35436 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
Grin2aP35436 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
Grin2aP35436 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
Grin2aP35436 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
Grin2aP35436 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
Grin2aP35436 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.65
Grin2aP35436 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.82■■■■□ 3.65
Grin2aP35436 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC37.82■■■■□ 3.64
Grin2aP35436 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
Grin2aP35436 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC37.81■■■■□ 3.64
Grin2aP35436 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC37.8■■■■□ 3.64
Grin2aP35436 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
Grin2aP35436 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
Grin2aP35436 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC37.78■■■■□ 3.64
Grin2aP35436 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC37.77■■■■□ 3.64
Grin2aP35436 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
Grin2aP35436 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC37.77■■■■□ 3.64
Grin2aP35436 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.77■■■■□ 3.64
Grin2aP35436 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.77■■■■□ 3.64
Grin2aP35436 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC37.77■■■■□ 3.64
Grin2aP35436 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC37.76■■■■□ 3.63
Grin2aP35436 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
Grin2aP35436 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC37.75■■■■□ 3.63
Grin2aP35436 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
Grin2aP35436 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
Grin2aP35436 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
Grin2aP35436 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.73■■■■□ 3.63
Grin2aP35436 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC37.73■■■■□ 3.63
Grin2aP35436 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
Grin2aP35436 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.72■■■■□ 3.63
Grin2aP35436 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC37.71■■■■□ 3.63
Grin2aP35436 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.7■■■■□ 3.63
Grin2aP35436 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
Grin2aP35436 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
Grin2aP35436 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.67■■■■□ 3.62
Grin2aP35436 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
Grin2aP35436 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.66■■■■□ 3.62
Grin2aP35436 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
Grin2aP35436 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
Grin2aP35436 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC37.64■■■■□ 3.62
Grin2aP35436 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC37.64■■■■□ 3.62
Grin2aP35436 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
Grin2aP35436 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
Grin2aP35436 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC37.61■■■■□ 3.61
Grin2aP35436 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
Grin2aP35436 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms