Protein–RNA interactions for Protein: P34056

Tfap2a, Transcription factor AP-2-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2aP34056 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tfap2aP34056 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tfap2aP34056 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tfap2aP34056 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tfap2aP34056 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tfap2aP34056 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Tfap2aP34056 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tfap2aP34056 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tfap2aP34056 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tfap2aP34056 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tfap2aP34056 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tfap2aP34056 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tfap2aP34056 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tfap2aP34056 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tfap2aP34056 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tfap2aP34056 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tfap2aP34056 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tfap2aP34056 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tfap2aP34056 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Tfap2aP34056 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tfap2aP34056 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tfap2aP34056 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tfap2aP34056 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tfap2aP34056 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tfap2aP34056 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Tfap2aP34056 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tfap2aP34056 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tfap2aP34056 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tfap2aP34056 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tfap2aP34056 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tfap2aP34056 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tfap2aP34056 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tfap2aP34056 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tfap2aP34056 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tfap2aP34056 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Tfap2aP34056 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tfap2aP34056 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tfap2aP34056 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tfap2aP34056 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tfap2aP34056 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tfap2aP34056 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tfap2aP34056 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tfap2aP34056 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tfap2aP34056 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tfap2aP34056 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tfap2aP34056 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tfap2aP34056 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tfap2aP34056 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tfap2aP34056 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tfap2aP34056 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tfap2aP34056 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tfap2aP34056 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tfap2aP34056 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tfap2aP34056 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tfap2aP34056 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tfap2aP34056 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Tfap2aP34056 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tfap2aP34056 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Tfap2aP34056 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tfap2aP34056 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tfap2aP34056 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tfap2aP34056 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tfap2aP34056 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tfap2aP34056 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tfap2aP34056 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tfap2aP34056 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tfap2aP34056 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tfap2aP34056 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tfap2aP34056 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tfap2aP34056 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tfap2aP34056 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tfap2aP34056 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Tfap2aP34056 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tfap2aP34056 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tfap2aP34056 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tfap2aP34056 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tfap2aP34056 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tfap2aP34056 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tfap2aP34056 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tfap2aP34056 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tfap2aP34056 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tfap2aP34056 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tfap2aP34056 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tfap2aP34056 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tfap2aP34056 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tfap2aP34056 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tfap2aP34056 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tfap2aP34056 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tfap2aP34056 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Tfap2aP34056 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tfap2aP34056 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tfap2aP34056 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tfap2aP34056 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tfap2aP34056 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tfap2aP34056 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tfap2aP34056 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tfap2aP34056 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tfap2aP34056 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tfap2aP34056 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tfap2aP34056 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms