Protein–RNA interactions for Protein: P31245

Hoxa2, Homeobox protein Hox-A2, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa2P31245 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hoxa2P31245 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hoxa2P31245 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hoxa2P31245 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hoxa2P31245 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hoxa2P31245 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hoxa2P31245 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hoxa2P31245 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hoxa2P31245 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hoxa2P31245 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hoxa2P31245 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hoxa2P31245 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Hoxa2P31245 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Hoxa2P31245 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hoxa2P31245 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hoxa2P31245 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Hoxa2P31245 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hoxa2P31245 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hoxa2P31245 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hoxa2P31245 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hoxa2P31245 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hoxa2P31245 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hoxa2P31245 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hoxa2P31245 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Hoxa2P31245 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hoxa2P31245 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hoxa2P31245 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hoxa2P31245 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hoxa2P31245 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hoxa2P31245 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hoxa2P31245 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hoxa2P31245 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Hoxa2P31245 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hoxa2P31245 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hoxa2P31245 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hoxa2P31245 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Hoxa2P31245 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hoxa2P31245 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Hoxa2P31245 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hoxa2P31245 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hoxa2P31245 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hoxa2P31245 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hoxa2P31245 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hoxa2P31245 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hoxa2P31245 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hoxa2P31245 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hoxa2P31245 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hoxa2P31245 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hoxa2P31245 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hoxa2P31245 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Hoxa2P31245 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hoxa2P31245 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Hoxa2P31245 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hoxa2P31245 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hoxa2P31245 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hoxa2P31245 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hoxa2P31245 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hoxa2P31245 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hoxa2P31245 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hoxa2P31245 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hoxa2P31245 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hoxa2P31245 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hoxa2P31245 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hoxa2P31245 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hoxa2P31245 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hoxa2P31245 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hoxa2P31245 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hoxa2P31245 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hoxa2P31245 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hoxa2P31245 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hoxa2P31245 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hoxa2P31245 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hoxa2P31245 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hoxa2P31245 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Hoxa2P31245 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Hoxa2P31245 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Hoxa2P31245 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hoxa2P31245 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Hoxa2P31245 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hoxa2P31245 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hoxa2P31245 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Hoxa2P31245 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hoxa2P31245 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hoxa2P31245 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hoxa2P31245 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hoxa2P31245 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Hoxa2P31245 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hoxa2P31245 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Hoxa2P31245 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hoxa2P31245 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hoxa2P31245 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hoxa2P31245 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hoxa2P31245 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hoxa2P31245 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hoxa2P31245 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hoxa2P31245 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hoxa2P31245 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hoxa2P31245 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hoxa2P31245 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hoxa2P31245 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms