Protein–RNA interactions for Protein: P30999

Ctnnd1, Catenin delta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnd1P30999 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ctnnd1P30999 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ctnnd1P30999 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ctnnd1P30999 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ctnnd1P30999 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ctnnd1P30999 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ctnnd1P30999 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ctnnd1P30999 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ctnnd1P30999 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Ctnnd1P30999 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ctnnd1P30999 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ctnnd1P30999 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ctnnd1P30999 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ctnnd1P30999 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ctnnd1P30999 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ctnnd1P30999 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ctnnd1P30999 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ctnnd1P30999 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ctnnd1P30999 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ctnnd1P30999 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ctnnd1P30999 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ctnnd1P30999 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ctnnd1P30999 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ctnnd1P30999 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Ctnnd1P30999 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ctnnd1P30999 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ctnnd1P30999 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ctnnd1P30999 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ctnnd1P30999 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ctnnd1P30999 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ctnnd1P30999 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ctnnd1P30999 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ctnnd1P30999 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ctnnd1P30999 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ctnnd1P30999 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ctnnd1P30999 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ctnnd1P30999 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ctnnd1P30999 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ctnnd1P30999 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ctnnd1P30999 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Ctnnd1P30999 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ctnnd1P30999 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Ctnnd1P30999 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ctnnd1P30999 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ctnnd1P30999 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ctnnd1P30999 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ctnnd1P30999 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ctnnd1P30999 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ctnnd1P30999 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ctnnd1P30999 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ctnnd1P30999 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ctnnd1P30999 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ctnnd1P30999 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ctnnd1P30999 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Ctnnd1P30999 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ctnnd1P30999 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ctnnd1P30999 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ctnnd1P30999 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ctnnd1P30999 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ctnnd1P30999 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ctnnd1P30999 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ctnnd1P30999 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ctnnd1P30999 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ctnnd1P30999 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ctnnd1P30999 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ctnnd1P30999 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ctnnd1P30999 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ctnnd1P30999 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ctnnd1P30999 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ctnnd1P30999 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ctnnd1P30999 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ctnnd1P30999 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ctnnd1P30999 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ctnnd1P30999 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ctnnd1P30999 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ctnnd1P30999 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ctnnd1P30999 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ctnnd1P30999 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ctnnd1P30999 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ctnnd1P30999 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ctnnd1P30999 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ctnnd1P30999 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ctnnd1P30999 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Ctnnd1P30999 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ctnnd1P30999 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Ctnnd1P30999 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Ctnnd1P30999 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ctnnd1P30999 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ctnnd1P30999 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ctnnd1P30999 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ctnnd1P30999 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ctnnd1P30999 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ctnnd1P30999 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ctnnd1P30999 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ctnnd1P30999 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ctnnd1P30999 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ctnnd1P30999 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ctnnd1P30999 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ctnnd1P30999 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ctnnd1P30999 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.4 ms