Protein–RNA interactions for Protein: P29416

Hexa, Beta-hexosaminidase subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HexaP29416 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HexaP29416 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HexaP29416 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HexaP29416 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HexaP29416 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HexaP29416 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HexaP29416 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HexaP29416 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HexaP29416 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
HexaP29416 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HexaP29416 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HexaP29416 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HexaP29416 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HexaP29416 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HexaP29416 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HexaP29416 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HexaP29416 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
HexaP29416 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HexaP29416 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HexaP29416 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HexaP29416 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HexaP29416 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HexaP29416 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
HexaP29416 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HexaP29416 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HexaP29416 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HexaP29416 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
HexaP29416 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HexaP29416 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
HexaP29416 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HexaP29416 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HexaP29416 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
HexaP29416 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HexaP29416 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HexaP29416 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
HexaP29416 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HexaP29416 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HexaP29416 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HexaP29416 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HexaP29416 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
HexaP29416 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HexaP29416 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HexaP29416 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HexaP29416 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HexaP29416 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HexaP29416 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HexaP29416 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HexaP29416 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HexaP29416 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HexaP29416 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HexaP29416 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HexaP29416 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
HexaP29416 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HexaP29416 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HexaP29416 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HexaP29416 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HexaP29416 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HexaP29416 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HexaP29416 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HexaP29416 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
HexaP29416 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HexaP29416 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HexaP29416 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HexaP29416 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HexaP29416 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HexaP29416 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HexaP29416 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HexaP29416 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
HexaP29416 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
HexaP29416 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HexaP29416 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HexaP29416 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HexaP29416 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HexaP29416 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HexaP29416 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HexaP29416 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HexaP29416 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HexaP29416 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HexaP29416 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HexaP29416 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HexaP29416 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HexaP29416 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HexaP29416 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
HexaP29416 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
HexaP29416 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HexaP29416 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
HexaP29416 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
HexaP29416 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HexaP29416 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HexaP29416 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HexaP29416 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HexaP29416 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HexaP29416 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HexaP29416 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HexaP29416 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HexaP29416 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HexaP29416 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HexaP29416 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
HexaP29416 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HexaP29416 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms