Protein–RNA interactions for Protein: P28660

Nckap1, Nck-associated protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nckap1P28660 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nckap1P28660 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Nckap1P28660 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nckap1P28660 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nckap1P28660 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nckap1P28660 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nckap1P28660 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nckap1P28660 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nckap1P28660 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nckap1P28660 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nckap1P28660 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nckap1P28660 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nckap1P28660 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nckap1P28660 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nckap1P28660 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nckap1P28660 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nckap1P28660 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Nckap1P28660 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nckap1P28660 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nckap1P28660 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nckap1P28660 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nckap1P28660 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nckap1P28660 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nckap1P28660 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nckap1P28660 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nckap1P28660 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nckap1P28660 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Nckap1P28660 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Nckap1P28660 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Nckap1P28660 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nckap1P28660 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Nckap1P28660 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nckap1P28660 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nckap1P28660 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Nckap1P28660 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nckap1P28660 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nckap1P28660 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nckap1P28660 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nckap1P28660 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Nckap1P28660 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nckap1P28660 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nckap1P28660 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nckap1P28660 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nckap1P28660 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nckap1P28660 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nckap1P28660 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nckap1P28660 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nckap1P28660 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nckap1P28660 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nckap1P28660 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nckap1P28660 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Nckap1P28660 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Nckap1P28660 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nckap1P28660 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nckap1P28660 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nckap1P28660 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Nckap1P28660 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Nckap1P28660 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nckap1P28660 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nckap1P28660 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Nckap1P28660 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nckap1P28660 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nckap1P28660 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nckap1P28660 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nckap1P28660 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nckap1P28660 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nckap1P28660 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nckap1P28660 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nckap1P28660 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Nckap1P28660 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Nckap1P28660 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nckap1P28660 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nckap1P28660 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nckap1P28660 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nckap1P28660 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nckap1P28660 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Nckap1P28660 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nckap1P28660 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nckap1P28660 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nckap1P28660 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nckap1P28660 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nckap1P28660 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nckap1P28660 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Nckap1P28660 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nckap1P28660 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nckap1P28660 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nckap1P28660 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nckap1P28660 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nckap1P28660 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nckap1P28660 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nckap1P28660 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nckap1P28660 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nckap1P28660 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nckap1P28660 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Nckap1P28660 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nckap1P28660 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nckap1P28660 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nckap1P28660 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nckap1P28660 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nckap1P28660 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms