Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Hoxd10P28359 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Hoxd10P28359 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Hoxd10P28359 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Hoxd10P28359 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Hoxd10P28359 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Hoxd10P28359 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Hoxd10P28359 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Hoxd10P28359 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Hoxd10P28359 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Hoxd10P28359 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Hoxd10P28359 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Hoxd10P28359 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Hoxd10P28359 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Hoxd10P28359 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Hoxd10P28359 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Hoxd10P28359 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Hoxd10P28359 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Hoxd10P28359 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Hoxd10P28359 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Hoxd10P28359 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Hoxd10P28359 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Hoxd10P28359 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Hoxd10P28359 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Hoxd10P28359 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Hoxd10P28359 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Hoxd10P28359 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Hoxd10P28359 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Hoxd10P28359 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Hoxd10P28359 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Hoxd10P28359 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Hoxd10P28359 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Hoxd10P28359 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Hoxd10P28359 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Hoxd10P28359 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Hoxd10P28359 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Hoxd10P28359 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Hoxd10P28359 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Hoxd10P28359 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Hoxd10P28359 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Hoxd10P28359 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Hoxd10P28359 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Hoxd10P28359 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Hoxd10P28359 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Hoxd10P28359 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Hoxd10P28359 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Hoxd10P28359 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Hoxd10P28359 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Hoxd10P28359 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Hoxd10P28359 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Hoxd10P28359 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Hoxd10P28359 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Hoxd10P28359 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Hoxd10P28359 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Hoxd10P28359 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Hoxd10P28359 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Hoxd10P28359 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Hoxd10P28359 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Hoxd10P28359 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Hoxd10P28359 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Hoxd10P28359 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Hoxd10P28359 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Hoxd10P28359 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Hoxd10P28359 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Hoxd10P28359 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Hoxd10P28359 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Hoxd10P28359 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Hoxd10P28359 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Hoxd10P28359 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Hoxd10P28359 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Hoxd10P28359 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Hoxd10P28359 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Hoxd10P28359 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Hoxd10P28359 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Hoxd10P28359 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Hoxd10P28359 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Hoxd10P28359 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Hoxd10P28359 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Hoxd10P28359 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Hoxd10P28359 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Hoxd10P28359 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Hoxd10P28359 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Hoxd10P28359 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Hoxd10P28359 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Hoxd10P28359 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Hoxd10P28359 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Hoxd10P28359 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Hoxd10P28359 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Hoxd10P28359 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Hoxd10P28359 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Hoxd10P28359 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Hoxd10P28359 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Hoxd10P28359 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Hoxd10P28359 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Hoxd10P28359 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Hoxd10P28359 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Hoxd10P28359 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Hoxd10P28359 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Hoxd10P28359 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Hoxd10P28359 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
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