Protein–RNA interactions for Protein: P24788

Cdk11b, Cyclin-dependent kinase 11B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk11bP24788 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
Cdk11bP24788 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Cdk11bP24788 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC35.49■■■■□ 3.27
Cdk11bP24788 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC35.49■■■■□ 3.27
Cdk11bP24788 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
Cdk11bP24788 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC35.49■■■■□ 3.27
Cdk11bP24788 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC35.49■■■■□ 3.27
Cdk11bP24788 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC35.48■■■■□ 3.27
Cdk11bP24788 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
Cdk11bP24788 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Cdk11bP24788 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC35.48■■■■□ 3.27
Cdk11bP24788 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Cdk11bP24788 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Cdk11bP24788 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Cdk11bP24788 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
Cdk11bP24788 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.27
Cdk11bP24788 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
Cdk11bP24788 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC35.44■■■■□ 3.26
Cdk11bP24788 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
Cdk11bP24788 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC35.43■■■■□ 3.26
Cdk11bP24788 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Cdk11bP24788 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.43■■■■□ 3.26
Cdk11bP24788 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Cdk11bP24788 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Cdk11bP24788 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC35.41■■■■□ 3.26
Cdk11bP24788 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Cdk11bP24788 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Cdk11bP24788 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Cdk11bP24788 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Cdk11bP24788 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Cdk11bP24788 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
Cdk11bP24788 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
Cdk11bP24788 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Cdk11bP24788 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Cdk11bP24788 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
Cdk11bP24788 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
Cdk11bP24788 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Cdk11bP24788 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
Cdk11bP24788 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Cdk11bP24788 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Cdk11bP24788 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Cdk11bP24788 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Cdk11bP24788 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
Cdk11bP24788 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
Cdk11bP24788 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Cdk11bP24788 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC35.34■■■■□ 3.25
Cdk11bP24788 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
Cdk11bP24788 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Cdk11bP24788 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Cdk11bP24788 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Cdk11bP24788 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Cdk11bP24788 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Cdk11bP24788 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Cdk11bP24788 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Cdk11bP24788 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Cdk11bP24788 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
Cdk11bP24788 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC35.29■■■■□ 3.24
Cdk11bP24788 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC35.29■■■■□ 3.24
Cdk11bP24788 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
Cdk11bP24788 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
Cdk11bP24788 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Cdk11bP24788 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Cdk11bP24788 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Cdk11bP24788 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Cdk11bP24788 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
Cdk11bP24788 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Cdk11bP24788 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
Cdk11bP24788 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
Cdk11bP24788 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Cdk11bP24788 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Cdk11bP24788 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
Cdk11bP24788 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC35.22■■■■□ 3.23
Cdk11bP24788 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Cdk11bP24788 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC35.21■■■■□ 3.23
Cdk11bP24788 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
Cdk11bP24788 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC35.21■■■■□ 3.23
Cdk11bP24788 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Cdk11bP24788 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Cdk11bP24788 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
Cdk11bP24788 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Cdk11bP24788 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Cdk11bP24788 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
Cdk11bP24788 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Cdk11bP24788 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Cdk11bP24788 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC35.17■■■■□ 3.22
Cdk11bP24788 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC35.17■■■■□ 3.22
Cdk11bP24788 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Cdk11bP24788 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
Cdk11bP24788 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Cdk11bP24788 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Cdk11bP24788 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Cdk11bP24788 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Cdk11bP24788 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Cdk11bP24788 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
Cdk11bP24788 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Cdk11bP24788 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Cdk11bP24788 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Cdk11bP24788 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Cdk11bP24788 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
Cdk11bP24788 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 164 ms