Protein–RNA interactions for Protein: P23813

Hoxd11, Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

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Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11P23813 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Hoxd11P23813 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Hoxd11P23813 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Hoxd11P23813 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Hoxd11P23813 Olfr1233-203ENSMUST00000215469 1205 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Hoxd11P23813 Olfr1233-204ENSMUST00000216561 1192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Hoxd11P23813 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Hoxd11P23813 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Hoxd11P23813 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Hoxd11P23813 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Hoxd11P23813 AV099323-201ENSMUST00000124336 921 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Hoxd11P23813 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Hoxd11P23813 Gm37319-201ENSMUST00000193500 636 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Hoxd11P23813 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Hoxd11P23813 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Hoxd11P23813 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Hoxd11P23813 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Hoxd11P23813 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Hoxd11P23813 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Hoxd11P23813 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Hoxd11P23813 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Hoxd11P23813 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Hoxd11P23813 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Hoxd11P23813 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Hoxd11P23813 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Hoxd11P23813 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Hoxd11P23813 D530018E20Rik-201ENSMUST00000205107 958 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Hoxd11P23813 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Hoxd11P23813 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Hoxd11P23813 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Hoxd11P23813 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Hoxd11P23813 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Hoxd11P23813 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Hoxd11P23813 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Hoxd11P23813 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Hoxd11P23813 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Hoxd11P23813 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Hoxd11P23813 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Hoxd11P23813 Gm38134-201ENSMUST00000191858 1234 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Hoxd11P23813 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Hoxd11P23813 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Hoxd11P23813 Gm42726-201ENSMUST00000202274 1286 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Hoxd11P23813 Gm11569-201ENSMUST00000105057 869 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Hoxd11P23813 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Hoxd11P23813 Gm45878-201ENSMUST00000211839 241 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Hoxd11P23813 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Hoxd11P23813 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Hoxd11P23813 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Hoxd11P23813 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Hoxd11P23813 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Hoxd11P23813 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Hoxd11P23813 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Hoxd11P23813 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Hoxd11P23813 4930405J17Rik-201ENSMUST00000214323 620 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Hoxd11P23813 AC142191.1-201ENSMUST00000219217 699 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Hoxd11P23813 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Hoxd11P23813 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Hoxd11P23813 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Hoxd11P23813 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Hoxd11P23813 G530012D18Rik-201ENSMUST00000178024 420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Hoxd11P23813 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Hoxd11P23813 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Hoxd11P23813 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Hoxd11P23813 Klk1b7-ps-201ENSMUST00000078897 448 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Hoxd11P23813 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Hoxd11P23813 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Hoxd11P23813 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Hoxd11P23813 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Hoxd11P23813 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Hoxd11P23813 6530401F13Rik-201ENSMUST00000166971 1090 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Hoxd11P23813 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Hoxd11P23813 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Hoxd11P23813 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Hoxd11P23813 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Hoxd11P23813 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Hoxd11P23813 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Hoxd11P23813 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Hoxd11P23813 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Hoxd11P23813 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Hoxd11P23813 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Hoxd11P23813 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Hoxd11P23813 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Hoxd11P23813 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Hoxd11P23813 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Hoxd11P23813 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Hoxd11P23813 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Hoxd11P23813 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Hoxd11P23813 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Hoxd11P23813 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Hoxd11P23813 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Hoxd11P23813 Gm8369-204ENSMUST00000188633 1227 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Hoxd11P23813 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Hoxd11P23813 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Hoxd11P23813 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Hoxd11P23813 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Hoxd11P23813 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Hoxd11P23813 Gm14913-201ENSMUST00000120011 1093 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Hoxd11P23813 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Hoxd11P23813 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Hoxd11P23813 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
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