Protein–RNA interactions for Protein: P21619

Lmnb2, Lamin-B2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmnb2P21619 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lmnb2P21619 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lmnb2P21619 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lmnb2P21619 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lmnb2P21619 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lmnb2P21619 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lmnb2P21619 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lmnb2P21619 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lmnb2P21619 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lmnb2P21619 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Lmnb2P21619 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lmnb2P21619 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lmnb2P21619 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lmnb2P21619 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lmnb2P21619 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lmnb2P21619 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lmnb2P21619 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lmnb2P21619 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lmnb2P21619 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lmnb2P21619 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lmnb2P21619 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lmnb2P21619 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lmnb2P21619 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lmnb2P21619 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Lmnb2P21619 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Lmnb2P21619 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lmnb2P21619 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lmnb2P21619 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lmnb2P21619 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lmnb2P21619 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lmnb2P21619 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lmnb2P21619 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lmnb2P21619 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Lmnb2P21619 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Lmnb2P21619 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Lmnb2P21619 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lmnb2P21619 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lmnb2P21619 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lmnb2P21619 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lmnb2P21619 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lmnb2P21619 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lmnb2P21619 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lmnb2P21619 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Lmnb2P21619 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lmnb2P21619 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lmnb2P21619 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lmnb2P21619 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lmnb2P21619 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lmnb2P21619 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lmnb2P21619 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lmnb2P21619 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lmnb2P21619 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lmnb2P21619 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lmnb2P21619 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lmnb2P21619 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Lmnb2P21619 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lmnb2P21619 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lmnb2P21619 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Lmnb2P21619 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lmnb2P21619 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lmnb2P21619 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lmnb2P21619 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lmnb2P21619 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Lmnb2P21619 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lmnb2P21619 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lmnb2P21619 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lmnb2P21619 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lmnb2P21619 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lmnb2P21619 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lmnb2P21619 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lmnb2P21619 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lmnb2P21619 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lmnb2P21619 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lmnb2P21619 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lmnb2P21619 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lmnb2P21619 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lmnb2P21619 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lmnb2P21619 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lmnb2P21619 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lmnb2P21619 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lmnb2P21619 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lmnb2P21619 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lmnb2P21619 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lmnb2P21619 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lmnb2P21619 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lmnb2P21619 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lmnb2P21619 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lmnb2P21619 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lmnb2P21619 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lmnb2P21619 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lmnb2P21619 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lmnb2P21619 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lmnb2P21619 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lmnb2P21619 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lmnb2P21619 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Lmnb2P21619 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lmnb2P21619 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lmnb2P21619 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lmnb2P21619 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lmnb2P21619 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 468.8 ms