Protein–RNA interactions for Protein: P21278

Gna11, Guanine nucleotide-binding protein subunit alpha-11, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gna11P21278 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Gna11P21278 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Gna11P21278 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Gna11P21278 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Gna11P21278 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Gna11P21278 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Gna11P21278 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Gna11P21278 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Gna11P21278 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Gna11P21278 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Gna11P21278 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Gna11P21278 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Gna11P21278 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Gna11P21278 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Gna11P21278 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Gna11P21278 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Gna11P21278 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Gna11P21278 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Gna11P21278 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Gna11P21278 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Gna11P21278 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Gna11P21278 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Gna11P21278 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Gna11P21278 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Gna11P21278 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Gna11P21278 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Gna11P21278 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Gna11P21278 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Gna11P21278 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Gna11P21278 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Gna11P21278 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Gna11P21278 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Gna11P21278 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Gna11P21278 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Gna11P21278 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Gna11P21278 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Gna11P21278 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Gna11P21278 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Gna11P21278 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Gna11P21278 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Gna11P21278 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Gna11P21278 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Gna11P21278 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Gna11P21278 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Gna11P21278 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Gna11P21278 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gna11P21278 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Gna11P21278 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Gna11P21278 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Gna11P21278 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Gna11P21278 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Gna11P21278 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Gna11P21278 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Gna11P21278 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Gna11P21278 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC26.33■■□□□ 1.8
Gna11P21278 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Gna11P21278 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Gna11P21278 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Gna11P21278 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Gna11P21278 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Gna11P21278 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Gna11P21278 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Gna11P21278 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Gna11P21278 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Gna11P21278 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Gna11P21278 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Gna11P21278 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Gna11P21278 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Gna11P21278 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Gna11P21278 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Gna11P21278 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Gna11P21278 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Gna11P21278 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Gna11P21278 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Gna11P21278 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Gna11P21278 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Gna11P21278 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Gna11P21278 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Gna11P21278 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Gna11P21278 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Gna11P21278 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Gna11P21278 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Gna11P21278 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Gna11P21278 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Gna11P21278 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Gna11P21278 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Gna11P21278 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Gna11P21278 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Gna11P21278 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Gna11P21278 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Gna11P21278 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Gna11P21278 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Gna11P21278 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Gna11P21278 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Gna11P21278 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Gna11P21278 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Gna11P21278 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Gna11P21278 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Gna11P21278 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Gna11P21278 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms