Protein–RNA interactions for Protein: P20612

Gnat1, Guanine nucleotide-binding protein G(t) subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gnat1P20612 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gnat1P20612 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gnat1P20612 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gnat1P20612 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gnat1P20612 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gnat1P20612 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gnat1P20612 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gnat1P20612 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gnat1P20612 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gnat1P20612 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gnat1P20612 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gnat1P20612 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gnat1P20612 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Gnat1P20612 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gnat1P20612 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gnat1P20612 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gnat1P20612 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gnat1P20612 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Gnat1P20612 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gnat1P20612 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gnat1P20612 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gnat1P20612 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gnat1P20612 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gnat1P20612 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Gnat1P20612 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gnat1P20612 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gnat1P20612 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gnat1P20612 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gnat1P20612 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gnat1P20612 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gnat1P20612 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gnat1P20612 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gnat1P20612 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gnat1P20612 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gnat1P20612 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gnat1P20612 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gnat1P20612 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gnat1P20612 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gnat1P20612 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gnat1P20612 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gnat1P20612 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gnat1P20612 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gnat1P20612 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Gnat1P20612 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gnat1P20612 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Gnat1P20612 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gnat1P20612 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gnat1P20612 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gnat1P20612 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Gnat1P20612 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gnat1P20612 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Gnat1P20612 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gnat1P20612 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gnat1P20612 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Gnat1P20612 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Gnat1P20612 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gnat1P20612 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gnat1P20612 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Gnat1P20612 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gnat1P20612 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gnat1P20612 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gnat1P20612 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gnat1P20612 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Gnat1P20612 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gnat1P20612 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gnat1P20612 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gnat1P20612 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gnat1P20612 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gnat1P20612 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gnat1P20612 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gnat1P20612 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gnat1P20612 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gnat1P20612 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gnat1P20612 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Gnat1P20612 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gnat1P20612 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gnat1P20612 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gnat1P20612 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gnat1P20612 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gnat1P20612 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Gnat1P20612 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gnat1P20612 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gnat1P20612 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gnat1P20612 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gnat1P20612 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gnat1P20612 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gnat1P20612 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gnat1P20612 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gnat1P20612 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Gnat1P20612 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gnat1P20612 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gnat1P20612 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gnat1P20612 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gnat1P20612 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gnat1P20612 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gnat1P20612 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gnat1P20612 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Gnat1P20612 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gnat1P20612 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gnat1P20612 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 172.3 ms