Protein–RNA interactions for Protein: P19426

Nelfe, Negative elongation factor E, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NelfeP19426 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NelfeP19426 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NelfeP19426 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NelfeP19426 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NelfeP19426 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NelfeP19426 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NelfeP19426 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NelfeP19426 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NelfeP19426 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NelfeP19426 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NelfeP19426 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NelfeP19426 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NelfeP19426 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NelfeP19426 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NelfeP19426 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NelfeP19426 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NelfeP19426 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NelfeP19426 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NelfeP19426 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NelfeP19426 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NelfeP19426 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NelfeP19426 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NelfeP19426 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NelfeP19426 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NelfeP19426 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NelfeP19426 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NelfeP19426 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NelfeP19426 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NelfeP19426 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NelfeP19426 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NelfeP19426 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NelfeP19426 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NelfeP19426 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NelfeP19426 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NelfeP19426 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NelfeP19426 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NelfeP19426 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NelfeP19426 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NelfeP19426 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NelfeP19426 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NelfeP19426 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NelfeP19426 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
NelfeP19426 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NelfeP19426 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NelfeP19426 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NelfeP19426 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NelfeP19426 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NelfeP19426 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NelfeP19426 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NelfeP19426 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NelfeP19426 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NelfeP19426 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NelfeP19426 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NelfeP19426 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NelfeP19426 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NelfeP19426 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NelfeP19426 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NelfeP19426 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NelfeP19426 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NelfeP19426 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NelfeP19426 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NelfeP19426 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NelfeP19426 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NelfeP19426 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NelfeP19426 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NelfeP19426 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NelfeP19426 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NelfeP19426 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NelfeP19426 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NelfeP19426 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NelfeP19426 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NelfeP19426 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NelfeP19426 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NelfeP19426 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NelfeP19426 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NelfeP19426 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NelfeP19426 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NelfeP19426 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NelfeP19426 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NelfeP19426 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NelfeP19426 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NelfeP19426 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NelfeP19426 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NelfeP19426 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NelfeP19426 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NelfeP19426 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NelfeP19426 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NelfeP19426 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NelfeP19426 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NelfeP19426 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NelfeP19426 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NelfeP19426 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NelfeP19426 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NelfeP19426 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NelfeP19426 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NelfeP19426 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NelfeP19426 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NelfeP19426 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NelfeP19426 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NelfeP19426 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms