Protein–RNA interactions for Protein: P19253

Rpl13a, 60S ribosomal protein L13a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl13aP19253 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rpl13aP19253 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rpl13aP19253 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rpl13aP19253 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rpl13aP19253 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rpl13aP19253 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rpl13aP19253 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Rpl13aP19253 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rpl13aP19253 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rpl13aP19253 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rpl13aP19253 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rpl13aP19253 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rpl13aP19253 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rpl13aP19253 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rpl13aP19253 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rpl13aP19253 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rpl13aP19253 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rpl13aP19253 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rpl13aP19253 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Rpl13aP19253 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpl13aP19253 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpl13aP19253 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpl13aP19253 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpl13aP19253 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpl13aP19253 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpl13aP19253 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpl13aP19253 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpl13aP19253 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpl13aP19253 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpl13aP19253 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpl13aP19253 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpl13aP19253 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpl13aP19253 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpl13aP19253 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpl13aP19253 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpl13aP19253 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpl13aP19253 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl13aP19253 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl13aP19253 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl13aP19253 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl13aP19253 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl13aP19253 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl13aP19253 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl13aP19253 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl13aP19253 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpl13aP19253 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpl13aP19253 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpl13aP19253 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpl13aP19253 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpl13aP19253 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpl13aP19253 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpl13aP19253 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpl13aP19253 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpl13aP19253 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpl13aP19253 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpl13aP19253 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl13aP19253 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl13aP19253 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl13aP19253 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl13aP19253 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl13aP19253 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl13aP19253 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl13aP19253 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl13aP19253 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl13aP19253 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl13aP19253 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl13aP19253 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl13aP19253 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl13aP19253 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl13aP19253 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl13aP19253 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl13aP19253 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl13aP19253 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl13aP19253 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl13aP19253 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl13aP19253 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl13aP19253 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl13aP19253 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl13aP19253 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl13aP19253 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl13aP19253 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl13aP19253 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpl13aP19253 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpl13aP19253 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpl13aP19253 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpl13aP19253 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpl13aP19253 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpl13aP19253 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpl13aP19253 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Rpl13aP19253 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rpl13aP19253 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rpl13aP19253 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpl13aP19253 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpl13aP19253 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpl13aP19253 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpl13aP19253 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpl13aP19253 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpl13aP19253 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpl13aP19253 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpl13aP19253 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.4 ms