Protein–RNA interactions for Protein: P11477

Defa1, Alpha-defensin 1, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa1P11477 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Defa1P11477 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Defa1P11477 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Defa1P11477 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Defa1P11477 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Defa1P11477 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Defa1P11477 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Defa1P11477 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Defa1P11477 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Defa1P11477 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Defa1P11477 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Defa1P11477 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Defa1P11477 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Defa1P11477 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Defa1P11477 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Defa1P11477 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Defa1P11477 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Defa1P11477 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Defa1P11477 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Defa1P11477 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Defa1P11477 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Defa1P11477 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Defa1P11477 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Defa1P11477 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Defa1P11477 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Defa1P11477 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Defa1P11477 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Defa1P11477 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Defa1P11477 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Defa1P11477 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Defa1P11477 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Defa1P11477 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Defa1P11477 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Defa1P11477 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Defa1P11477 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Defa1P11477 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Defa1P11477 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Defa1P11477 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Defa1P11477 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Defa1P11477 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Defa1P11477 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Defa1P11477 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Defa1P11477 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Defa1P11477 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Defa1P11477 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defa1P11477 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defa1P11477 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defa1P11477 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defa1P11477 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defa1P11477 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Defa1P11477 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Defa1P11477 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Defa1P11477 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Defa1P11477 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Defa1P11477 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Defa1P11477 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Defa1P11477 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Defa1P11477 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Defa1P11477 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Defa1P11477 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Defa1P11477 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Defa1P11477 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Defa1P11477 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Defa1P11477 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Defa1P11477 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Defa1P11477 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Defa1P11477 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Defa1P11477 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Defa1P11477 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Defa1P11477 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Defa1P11477 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Defa1P11477 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Defa1P11477 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Defa1P11477 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Defa1P11477 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Defa1P11477 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Defa1P11477 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Defa1P11477 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defa1P11477 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defa1P11477 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defa1P11477 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defa1P11477 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defa1P11477 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Defa1P11477 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Defa1P11477 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Defa1P11477 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Defa1P11477 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Defa1P11477 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Defa1P11477 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Defa1P11477 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Defa1P11477 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Defa1P11477 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Defa1P11477 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Defa1P11477 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Defa1P11477 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Defa1P11477 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Defa1P11477 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Defa1P11477 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Defa1P11477 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Defa1P11477 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms