Protein–RNA interactions for Protein: P10820

Prf1, Perforin-1, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prf1P10820 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Prf1P10820 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Prf1P10820 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Prf1P10820 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Prf1P10820 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Prf1P10820 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Prf1P10820 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Prf1P10820 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Prf1P10820 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Prf1P10820 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Prf1P10820 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Prf1P10820 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Prf1P10820 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Prf1P10820 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Prf1P10820 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Prf1P10820 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Prf1P10820 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Prf1P10820 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Prf1P10820 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Prf1P10820 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
Prf1P10820 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Prf1P10820 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Prf1P10820 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Prf1P10820 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Prf1P10820 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Prf1P10820 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Prf1P10820 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Prf1P10820 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Prf1P10820 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prf1P10820 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prf1P10820 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prf1P10820 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Prf1P10820 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Prf1P10820 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Prf1P10820 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Prf1P10820 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Prf1P10820 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Prf1P10820 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Prf1P10820 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Prf1P10820 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Prf1P10820 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Prf1P10820 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Prf1P10820 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Prf1P10820 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Prf1P10820 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Prf1P10820 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Prf1P10820 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Prf1P10820 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Prf1P10820 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Prf1P10820 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Prf1P10820 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Prf1P10820 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Prf1P10820 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Prf1P10820 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Prf1P10820 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Prf1P10820 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Prf1P10820 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Prf1P10820 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Prf1P10820 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Prf1P10820 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Prf1P10820 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Prf1P10820 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Prf1P10820 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Prf1P10820 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Prf1P10820 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Prf1P10820 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Prf1P10820 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Prf1P10820 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Prf1P10820 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
Prf1P10820 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Prf1P10820 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Prf1P10820 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Prf1P10820 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Prf1P10820 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Prf1P10820 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Prf1P10820 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Prf1P10820 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Prf1P10820 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Prf1P10820 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Prf1P10820 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Prf1P10820 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Prf1P10820 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Prf1P10820 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Prf1P10820 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Prf1P10820 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Prf1P10820 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Prf1P10820 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Prf1P10820 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Prf1P10820 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Prf1P10820 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Prf1P10820 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Prf1P10820 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Prf1P10820 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Prf1P10820 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Prf1P10820 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Prf1P10820 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Prf1P10820 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Prf1P10820 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Prf1P10820 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Prf1P10820 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms