Protein–RNA interactions for Protein: P0DP28

Calm3, Calmodulin-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calm3P0DP28 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Calm3P0DP28 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Calm3P0DP28 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Calm3P0DP28 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Calm3P0DP28 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Calm3P0DP28 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Calm3P0DP28 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Calm3P0DP28 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Calm3P0DP28 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Calm3P0DP28 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Calm3P0DP28 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Calm3P0DP28 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Calm3P0DP28 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Calm3P0DP28 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Calm3P0DP28 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Calm3P0DP28 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Calm3P0DP28 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Calm3P0DP28 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Calm3P0DP28 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Calm3P0DP28 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Calm3P0DP28 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Calm3P0DP28 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Calm3P0DP28 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Calm3P0DP28 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Calm3P0DP28 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Calm3P0DP28 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Calm3P0DP28 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Calm3P0DP28 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Calm3P0DP28 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Calm3P0DP28 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Calm3P0DP28 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Calm3P0DP28 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Calm3P0DP28 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Calm3P0DP28 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Calm3P0DP28 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Calm3P0DP28 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Calm3P0DP28 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Calm3P0DP28 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Calm3P0DP28 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Calm3P0DP28 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Calm3P0DP28 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Calm3P0DP28 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Calm3P0DP28 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Calm3P0DP28 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Calm3P0DP28 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Calm3P0DP28 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Calm3P0DP28 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Calm3P0DP28 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Calm3P0DP28 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Calm3P0DP28 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Calm3P0DP28 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Calm3P0DP28 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Calm3P0DP28 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Calm3P0DP28 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Calm3P0DP28 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Calm3P0DP28 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Calm3P0DP28 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Calm3P0DP28 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Calm3P0DP28 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Calm3P0DP28 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Calm3P0DP28 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Calm3P0DP28 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Calm3P0DP28 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Calm3P0DP28 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Calm3P0DP28 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Calm3P0DP28 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Calm3P0DP28 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Calm3P0DP28 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Calm3P0DP28 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Calm3P0DP28 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Calm3P0DP28 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Calm3P0DP28 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Calm3P0DP28 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Calm3P0DP28 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Calm3P0DP28 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Calm3P0DP28 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Calm3P0DP28 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Calm3P0DP28 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Calm3P0DP28 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Calm3P0DP28 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Calm3P0DP28 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Calm3P0DP28 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Calm3P0DP28 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Calm3P0DP28 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Calm3P0DP28 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Calm3P0DP28 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Calm3P0DP28 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Calm3P0DP28 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Calm3P0DP28 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Calm3P0DP28 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Calm3P0DP28 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Calm3P0DP28 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Calm3P0DP28 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Calm3P0DP28 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Calm3P0DP28 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Calm3P0DP28 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Calm3P0DP28 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Calm3P0DP28 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Calm3P0DP28 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Calm3P0DP28 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms