Protein–RNA interactions for Protein: P0C5E4

Ptprq, Phosphatidylinositol phosphatase PTPRQ, mousemouse

Predictions only

Length 2,300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprqP0C5E4 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PtprqP0C5E4 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PtprqP0C5E4 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PtprqP0C5E4 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PtprqP0C5E4 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PtprqP0C5E4 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PtprqP0C5E4 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PtprqP0C5E4 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PtprqP0C5E4 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PtprqP0C5E4 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PtprqP0C5E4 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PtprqP0C5E4 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PtprqP0C5E4 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PtprqP0C5E4 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PtprqP0C5E4 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PtprqP0C5E4 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PtprqP0C5E4 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PtprqP0C5E4 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PtprqP0C5E4 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PtprqP0C5E4 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PtprqP0C5E4 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PtprqP0C5E4 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PtprqP0C5E4 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PtprqP0C5E4 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PtprqP0C5E4 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PtprqP0C5E4 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PtprqP0C5E4 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PtprqP0C5E4 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
PtprqP0C5E4 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PtprqP0C5E4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PtprqP0C5E4 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PtprqP0C5E4 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PtprqP0C5E4 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PtprqP0C5E4 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PtprqP0C5E4 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PtprqP0C5E4 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PtprqP0C5E4 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PtprqP0C5E4 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PtprqP0C5E4 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PtprqP0C5E4 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PtprqP0C5E4 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PtprqP0C5E4 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PtprqP0C5E4 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PtprqP0C5E4 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PtprqP0C5E4 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PtprqP0C5E4 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtprqP0C5E4 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtprqP0C5E4 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtprqP0C5E4 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtprqP0C5E4 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtprqP0C5E4 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtprqP0C5E4 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtprqP0C5E4 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PtprqP0C5E4 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PtprqP0C5E4 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PtprqP0C5E4 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PtprqP0C5E4 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PtprqP0C5E4 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PtprqP0C5E4 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PtprqP0C5E4 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PtprqP0C5E4 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PtprqP0C5E4 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtprqP0C5E4 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtprqP0C5E4 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtprqP0C5E4 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtprqP0C5E4 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PtprqP0C5E4 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
PtprqP0C5E4 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PtprqP0C5E4 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PtprqP0C5E4 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PtprqP0C5E4 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PtprqP0C5E4 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PtprqP0C5E4 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PtprqP0C5E4 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PtprqP0C5E4 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtprqP0C5E4 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtprqP0C5E4 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtprqP0C5E4 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtprqP0C5E4 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtprqP0C5E4 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtprqP0C5E4 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PtprqP0C5E4 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PtprqP0C5E4 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PtprqP0C5E4 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PtprqP0C5E4 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PtprqP0C5E4 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PtprqP0C5E4 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PtprqP0C5E4 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PtprqP0C5E4 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PtprqP0C5E4 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PtprqP0C5E4 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PtprqP0C5E4 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PtprqP0C5E4 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PtprqP0C5E4 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PtprqP0C5E4 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PtprqP0C5E4 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PtprqP0C5E4 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PtprqP0C5E4 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
PtprqP0C5E4 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
PtprqP0C5E4 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
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