Protein–RNA interactions for Protein: P09240

Cck, Cholecystokinin, mousemouse

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CckP09240 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CckP09240 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CckP09240 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CckP09240 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CckP09240 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CckP09240 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CckP09240 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CckP09240 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CckP09240 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CckP09240 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CckP09240 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CckP09240 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CckP09240 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CckP09240 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CckP09240 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CckP09240 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CckP09240 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CckP09240 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CckP09240 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CckP09240 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CckP09240 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CckP09240 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CckP09240 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CckP09240 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CckP09240 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CckP09240 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CckP09240 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CckP09240 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CckP09240 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CckP09240 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CckP09240 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CckP09240 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CckP09240 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CckP09240 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CckP09240 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CckP09240 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CckP09240 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CckP09240 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CckP09240 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CckP09240 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CckP09240 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CckP09240 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CckP09240 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CckP09240 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CckP09240 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CckP09240 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CckP09240 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CckP09240 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CckP09240 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CckP09240 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CckP09240 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CckP09240 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CckP09240 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CckP09240 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CckP09240 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CckP09240 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CckP09240 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CckP09240 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CckP09240 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CckP09240 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CckP09240 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CckP09240 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CckP09240 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CckP09240 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CckP09240 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CckP09240 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CckP09240 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CckP09240 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CckP09240 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CckP09240 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CckP09240 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CckP09240 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CckP09240 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CckP09240 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CckP09240 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CckP09240 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CckP09240 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CckP09240 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CckP09240 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CckP09240 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CckP09240 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CckP09240 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CckP09240 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CckP09240 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CckP09240 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CckP09240 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CckP09240 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CckP09240 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CckP09240 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CckP09240 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CckP09240 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CckP09240 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CckP09240 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CckP09240 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CckP09240 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CckP09240 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CckP09240 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CckP09240 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CckP09240 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CckP09240 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms