Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Spta1P08032 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Spta1P08032 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Spta1P08032 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Spta1P08032 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Spta1P08032 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Spta1P08032 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Spta1P08032 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Spta1P08032 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Spta1P08032 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Spta1P08032 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Spta1P08032 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Spta1P08032 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Spta1P08032 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Spta1P08032 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Spta1P08032 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Spta1P08032 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Spta1P08032 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Spta1P08032 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Spta1P08032 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Spta1P08032 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Spta1P08032 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Spta1P08032 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Spta1P08032 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Spta1P08032 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Spta1P08032 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Spta1P08032 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Spta1P08032 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Spta1P08032 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Spta1P08032 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Spta1P08032 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Spta1P08032 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Spta1P08032 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Spta1P08032 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Spta1P08032 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Spta1P08032 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Spta1P08032 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Spta1P08032 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Spta1P08032 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Spta1P08032 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Spta1P08032 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Spta1P08032 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Spta1P08032 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Spta1P08032 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Spta1P08032 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Spta1P08032 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Spta1P08032 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Spta1P08032 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Spta1P08032 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Spta1P08032 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Spta1P08032 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Spta1P08032 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Spta1P08032 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Spta1P08032 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Spta1P08032 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Spta1P08032 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Spta1P08032 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Spta1P08032 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Spta1P08032 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Spta1P08032 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Spta1P08032 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Spta1P08032 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Spta1P08032 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Spta1P08032 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Spta1P08032 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Spta1P08032 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Spta1P08032 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Spta1P08032 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Spta1P08032 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Spta1P08032 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Spta1P08032 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Spta1P08032 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Spta1P08032 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Spta1P08032 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Spta1P08032 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Spta1P08032 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Spta1P08032 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Spta1P08032 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Spta1P08032 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Spta1P08032 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Spta1P08032 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Spta1P08032 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Spta1P08032 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Spta1P08032 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Spta1P08032 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Spta1P08032 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Spta1P08032 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Spta1P08032 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Spta1P08032 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Spta1P08032 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Spta1P08032 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Spta1P08032 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Spta1P08032 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Spta1P08032 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Spta1P08032 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Spta1P08032 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Spta1P08032 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Spta1P08032 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Spta1P08032 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Spta1P08032 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
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