Protein–RNA interactions for Protein: P06804

Tnf, Tumor necrosis factor, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnfP06804 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TnfP06804 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TnfP06804 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TnfP06804 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TnfP06804 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TnfP06804 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TnfP06804 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TnfP06804 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TnfP06804 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TnfP06804 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TnfP06804 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TnfP06804 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
TnfP06804 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TnfP06804 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TnfP06804 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TnfP06804 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TnfP06804 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TnfP06804 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TnfP06804 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TnfP06804 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TnfP06804 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TnfP06804 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TnfP06804 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TnfP06804 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TnfP06804 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
TnfP06804 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TnfP06804 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TnfP06804 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TnfP06804 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
TnfP06804 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TnfP06804 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TnfP06804 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TnfP06804 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TnfP06804 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TnfP06804 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TnfP06804 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TnfP06804 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TnfP06804 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TnfP06804 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TnfP06804 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TnfP06804 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TnfP06804 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TnfP06804 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TnfP06804 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TnfP06804 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TnfP06804 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TnfP06804 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TnfP06804 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TnfP06804 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TnfP06804 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
TnfP06804 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TnfP06804 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TnfP06804 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TnfP06804 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TnfP06804 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TnfP06804 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TnfP06804 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TnfP06804 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TnfP06804 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TnfP06804 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TnfP06804 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TnfP06804 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TnfP06804 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TnfP06804 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TnfP06804 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TnfP06804 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TnfP06804 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TnfP06804 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TnfP06804 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TnfP06804 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TnfP06804 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TnfP06804 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TnfP06804 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TnfP06804 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TnfP06804 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TnfP06804 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TnfP06804 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TnfP06804 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TnfP06804 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TnfP06804 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TnfP06804 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TnfP06804 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TnfP06804 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TnfP06804 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TnfP06804 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TnfP06804 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TnfP06804 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TnfP06804 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TnfP06804 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TnfP06804 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TnfP06804 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TnfP06804 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TnfP06804 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TnfP06804 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TnfP06804 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TnfP06804 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TnfP06804 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TnfP06804 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TnfP06804 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TnfP06804 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.1 ms