Protein–RNA interactions for Protein: P06332

Cd4, T-cell surface glycoprotein CD4, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd4P06332 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cd4P06332 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cd4P06332 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cd4P06332 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cd4P06332 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cd4P06332 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cd4P06332 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cd4P06332 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cd4P06332 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cd4P06332 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cd4P06332 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cd4P06332 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cd4P06332 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cd4P06332 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cd4P06332 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cd4P06332 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cd4P06332 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cd4P06332 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cd4P06332 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cd4P06332 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cd4P06332 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cd4P06332 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Cd4P06332 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cd4P06332 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cd4P06332 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cd4P06332 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cd4P06332 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cd4P06332 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cd4P06332 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Cd4P06332 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cd4P06332 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cd4P06332 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cd4P06332 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cd4P06332 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cd4P06332 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cd4P06332 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cd4P06332 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cd4P06332 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cd4P06332 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Cd4P06332 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cd4P06332 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cd4P06332 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cd4P06332 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cd4P06332 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cd4P06332 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cd4P06332 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cd4P06332 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cd4P06332 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cd4P06332 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cd4P06332 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cd4P06332 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cd4P06332 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cd4P06332 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cd4P06332 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cd4P06332 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cd4P06332 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cd4P06332 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cd4P06332 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cd4P06332 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Cd4P06332 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cd4P06332 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cd4P06332 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cd4P06332 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cd4P06332 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cd4P06332 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cd4P06332 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cd4P06332 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cd4P06332 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cd4P06332 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cd4P06332 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cd4P06332 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cd4P06332 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cd4P06332 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cd4P06332 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cd4P06332 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cd4P06332 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cd4P06332 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cd4P06332 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cd4P06332 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cd4P06332 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cd4P06332 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cd4P06332 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cd4P06332 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cd4P06332 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cd4P06332 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cd4P06332 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cd4P06332 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cd4P06332 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cd4P06332 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cd4P06332 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Cd4P06332 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cd4P06332 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cd4P06332 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cd4P06332 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cd4P06332 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cd4P06332 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cd4P06332 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cd4P06332 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cd4P06332 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cd4P06332 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms