Protein–RNA interactions for Protein: P04342

Crygd, Gamma-crystallin D, mousemouse

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrygdP04342 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CrygdP04342 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CrygdP04342 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CrygdP04342 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CrygdP04342 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CrygdP04342 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CrygdP04342 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CrygdP04342 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CrygdP04342 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CrygdP04342 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CrygdP04342 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CrygdP04342 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CrygdP04342 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CrygdP04342 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CrygdP04342 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CrygdP04342 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CrygdP04342 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CrygdP04342 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CrygdP04342 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CrygdP04342 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CrygdP04342 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CrygdP04342 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CrygdP04342 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CrygdP04342 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CrygdP04342 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CrygdP04342 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CrygdP04342 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CrygdP04342 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CrygdP04342 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CrygdP04342 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CrygdP04342 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CrygdP04342 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CrygdP04342 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CrygdP04342 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CrygdP04342 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CrygdP04342 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CrygdP04342 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CrygdP04342 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CrygdP04342 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CrygdP04342 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CrygdP04342 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CrygdP04342 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CrygdP04342 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CrygdP04342 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CrygdP04342 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CrygdP04342 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CrygdP04342 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CrygdP04342 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CrygdP04342 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CrygdP04342 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CrygdP04342 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CrygdP04342 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CrygdP04342 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CrygdP04342 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CrygdP04342 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CrygdP04342 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CrygdP04342 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CrygdP04342 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CrygdP04342 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CrygdP04342 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CrygdP04342 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CrygdP04342 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CrygdP04342 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CrygdP04342 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CrygdP04342 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CrygdP04342 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CrygdP04342 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CrygdP04342 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CrygdP04342 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CrygdP04342 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CrygdP04342 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CrygdP04342 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CrygdP04342 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CrygdP04342 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CrygdP04342 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CrygdP04342 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CrygdP04342 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CrygdP04342 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CrygdP04342 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CrygdP04342 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CrygdP04342 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CrygdP04342 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CrygdP04342 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CrygdP04342 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CrygdP04342 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CrygdP04342 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CrygdP04342 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CrygdP04342 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CrygdP04342 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CrygdP04342 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CrygdP04342 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CrygdP04342 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CrygdP04342 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CrygdP04342 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CrygdP04342 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CrygdP04342 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CrygdP04342 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CrygdP04342 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CrygdP04342 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CrygdP04342 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.1 ms