Protein–RNA interactions for Protein: P02340

Tp53, Cellular tumor antigen p53, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53P02340 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tp53P02340 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tp53P02340 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tp53P02340 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tp53P02340 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tp53P02340 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tp53P02340 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Tp53P02340 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tp53P02340 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tp53P02340 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tp53P02340 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tp53P02340 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tp53P02340 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tp53P02340 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tp53P02340 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tp53P02340 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tp53P02340 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tp53P02340 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tp53P02340 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tp53P02340 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tp53P02340 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tp53P02340 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tp53P02340 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tp53P02340 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tp53P02340 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tp53P02340 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tp53P02340 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tp53P02340 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tp53P02340 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tp53P02340 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tp53P02340 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tp53P02340 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tp53P02340 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tp53P02340 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Tp53P02340 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tp53P02340 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tp53P02340 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tp53P02340 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tp53P02340 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tp53P02340 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tp53P02340 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tp53P02340 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tp53P02340 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tp53P02340 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tp53P02340 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tp53P02340 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tp53P02340 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tp53P02340 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tp53P02340 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tp53P02340 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tp53P02340 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tp53P02340 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tp53P02340 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tp53P02340 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tp53P02340 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Tp53P02340 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tp53P02340 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tp53P02340 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tp53P02340 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tp53P02340 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tp53P02340 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Tp53P02340 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tp53P02340 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Tp53P02340 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tp53P02340 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tp53P02340 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tp53P02340 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tp53P02340 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tp53P02340 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tp53P02340 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tp53P02340 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tp53P02340 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tp53P02340 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tp53P02340 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tp53P02340 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tp53P02340 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Tp53P02340 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tp53P02340 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tp53P02340 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tp53P02340 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tp53P02340 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tp53P02340 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tp53P02340 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tp53P02340 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tp53P02340 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tp53P02340 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tp53P02340 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tp53P02340 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tp53P02340 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tp53P02340 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tp53P02340 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tp53P02340 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tp53P02340 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tp53P02340 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tp53P02340 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Tp53P02340 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tp53P02340 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tp53P02340 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tp53P02340 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tp53P02340 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms