Protein–RNA interactions for Protein: P01736

T-cell receptor beta chain V region PHDS203 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01736 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
P01736 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
P01736 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
P01736 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01736 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01736 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01736 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01736 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01736 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01736 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01736 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01736 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01736 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01736 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01736 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01736 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
P01736 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01736 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01736 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01736 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01736 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01736 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01736 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01736 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01736 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01736 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01736 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01736 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01736 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01736 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01736 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01736 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01736 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01736 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01736 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01736 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01736 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01736 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01736 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01736 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01736 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01736 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01736 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
P01736 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01736 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01736 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01736 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01736 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01736 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01736 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01736 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01736 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01736 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01736 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01736 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01736 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01736 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01736 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P01736 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P01736 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P01736 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P01736 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
P01736 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P01736 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
P01736 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
P01736 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
P01736 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
P01736 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
P01736 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
P01736 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
P01736 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
P01736 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
P01736 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
P01736 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
P01736 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
P01736 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
P01736 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
P01736 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
P01736 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
P01736 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
P01736 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
P01736 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
P01736 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
P01736 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
P01736 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
P01736 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
P01736 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
P01736 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
P01736 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
P01736 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
P01736 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
P01736 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
P01736 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
P01736 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
P01736 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
P01736 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
P01736 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
P01736 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
P01736 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
P01736 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms