Protein–RNA interactions for Protein: O88834

Shd, SH2 domain-containing adapter protein D, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ShdO88834 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ShdO88834 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ShdO88834 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ShdO88834 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ShdO88834 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ShdO88834 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ShdO88834 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ShdO88834 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ShdO88834 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ShdO88834 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ShdO88834 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ShdO88834 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ShdO88834 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ShdO88834 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ShdO88834 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ShdO88834 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ShdO88834 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ShdO88834 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ShdO88834 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ShdO88834 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
ShdO88834 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ShdO88834 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ShdO88834 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ShdO88834 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ShdO88834 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ShdO88834 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ShdO88834 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ShdO88834 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ShdO88834 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ShdO88834 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ShdO88834 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ShdO88834 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ShdO88834 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ShdO88834 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ShdO88834 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ShdO88834 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ShdO88834 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ShdO88834 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ShdO88834 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ShdO88834 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ShdO88834 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ShdO88834 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ShdO88834 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ShdO88834 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ShdO88834 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ShdO88834 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ShdO88834 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ShdO88834 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ShdO88834 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ShdO88834 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ShdO88834 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ShdO88834 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ShdO88834 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ShdO88834 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ShdO88834 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ShdO88834 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ShdO88834 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ShdO88834 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ShdO88834 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ShdO88834 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ShdO88834 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ShdO88834 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ShdO88834 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ShdO88834 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ShdO88834 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ShdO88834 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ShdO88834 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ShdO88834 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ShdO88834 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ShdO88834 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ShdO88834 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ShdO88834 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ShdO88834 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ShdO88834 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ShdO88834 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ShdO88834 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ShdO88834 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ShdO88834 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ShdO88834 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ShdO88834 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ShdO88834 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ShdO88834 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ShdO88834 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ShdO88834 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ShdO88834 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ShdO88834 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
ShdO88834 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ShdO88834 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ShdO88834 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ShdO88834 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ShdO88834 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ShdO88834 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ShdO88834 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ShdO88834 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ShdO88834 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ShdO88834 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ShdO88834 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ShdO88834 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ShdO88834 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ShdO88834 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 222.5 ms