Protein–RNA interactions for Protein: O88554

Parp2, Poly [ADP-ribose] polymerase 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp2O88554 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Parp2O88554 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Parp2O88554 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Parp2O88554 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Parp2O88554 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Parp2O88554 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Parp2O88554 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Parp2O88554 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Parp2O88554 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Parp2O88554 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Parp2O88554 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Parp2O88554 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Parp2O88554 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Parp2O88554 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Parp2O88554 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Parp2O88554 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Parp2O88554 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Parp2O88554 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Parp2O88554 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Parp2O88554 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Parp2O88554 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Parp2O88554 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Parp2O88554 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Parp2O88554 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Parp2O88554 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Parp2O88554 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Parp2O88554 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Parp2O88554 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Parp2O88554 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Parp2O88554 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Parp2O88554 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Parp2O88554 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Parp2O88554 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Parp2O88554 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Parp2O88554 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Parp2O88554 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Parp2O88554 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Parp2O88554 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Parp2O88554 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Parp2O88554 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Parp2O88554 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Parp2O88554 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Parp2O88554 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Parp2O88554 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Parp2O88554 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Parp2O88554 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Parp2O88554 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Parp2O88554 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Parp2O88554 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Parp2O88554 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Parp2O88554 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Parp2O88554 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Parp2O88554 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Parp2O88554 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Parp2O88554 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Parp2O88554 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Parp2O88554 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Parp2O88554 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Parp2O88554 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Parp2O88554 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Parp2O88554 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Parp2O88554 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Parp2O88554 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Parp2O88554 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Parp2O88554 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Parp2O88554 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Parp2O88554 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Parp2O88554 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Parp2O88554 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Parp2O88554 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Parp2O88554 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Parp2O88554 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Parp2O88554 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Parp2O88554 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Parp2O88554 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Parp2O88554 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Parp2O88554 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Parp2O88554 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Parp2O88554 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Parp2O88554 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Parp2O88554 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Parp2O88554 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Parp2O88554 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Parp2O88554 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Parp2O88554 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Parp2O88554 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Parp2O88554 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Parp2O88554 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Parp2O88554 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Parp2O88554 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Parp2O88554 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Parp2O88554 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Parp2O88554 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Parp2O88554 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Parp2O88554 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Parp2O88554 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Parp2O88554 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Parp2O88554 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Parp2O88554 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Parp2O88554 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms