Protein–RNA interactions for Protein: O88398

Avil, Advillin, mousemouse

Predictions only

Length 819 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AvilO88398 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
AvilO88398 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
AvilO88398 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
AvilO88398 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
AvilO88398 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
AvilO88398 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
AvilO88398 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
AvilO88398 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
AvilO88398 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
AvilO88398 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
AvilO88398 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
AvilO88398 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
AvilO88398 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
AvilO88398 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
AvilO88398 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
AvilO88398 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
AvilO88398 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
AvilO88398 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
AvilO88398 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
AvilO88398 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
AvilO88398 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AvilO88398 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AvilO88398 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AvilO88398 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AvilO88398 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
AvilO88398 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
AvilO88398 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
AvilO88398 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
AvilO88398 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AvilO88398 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AvilO88398 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AvilO88398 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AvilO88398 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AvilO88398 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
AvilO88398 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
AvilO88398 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
AvilO88398 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AvilO88398 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
AvilO88398 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
AvilO88398 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
AvilO88398 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AvilO88398 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AvilO88398 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
AvilO88398 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AvilO88398 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
AvilO88398 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
AvilO88398 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
AvilO88398 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
AvilO88398 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
AvilO88398 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
AvilO88398 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
AvilO88398 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
AvilO88398 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
AvilO88398 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
AvilO88398 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AvilO88398 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
AvilO88398 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
AvilO88398 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
AvilO88398 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
AvilO88398 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
AvilO88398 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
AvilO88398 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
AvilO88398 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AvilO88398 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
AvilO88398 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AvilO88398 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AvilO88398 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AvilO88398 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
AvilO88398 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AvilO88398 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AvilO88398 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AvilO88398 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AvilO88398 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AvilO88398 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
AvilO88398 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
AvilO88398 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AvilO88398 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
AvilO88398 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
AvilO88398 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
AvilO88398 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
AvilO88398 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AvilO88398 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
AvilO88398 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AvilO88398 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AvilO88398 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AvilO88398 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AvilO88398 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AvilO88398 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
AvilO88398 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AvilO88398 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AvilO88398 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AvilO88398 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AvilO88398 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AvilO88398 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AvilO88398 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
AvilO88398 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
AvilO88398 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AvilO88398 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AvilO88398 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
AvilO88398 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms