Protein–RNA interactions for Protein: O70439

Stx7, Syntaxin-7, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx7O70439 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Stx7O70439 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Stx7O70439 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Stx7O70439 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Stx7O70439 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Stx7O70439 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Stx7O70439 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Stx7O70439 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Stx7O70439 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Stx7O70439 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Stx7O70439 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Stx7O70439 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Stx7O70439 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Stx7O70439 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Stx7O70439 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Stx7O70439 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Stx7O70439 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Stx7O70439 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Stx7O70439 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Stx7O70439 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Stx7O70439 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Stx7O70439 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Stx7O70439 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Stx7O70439 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Stx7O70439 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Stx7O70439 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Stx7O70439 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Stx7O70439 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Stx7O70439 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Stx7O70439 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Stx7O70439 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Stx7O70439 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Stx7O70439 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Stx7O70439 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Stx7O70439 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Stx7O70439 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Stx7O70439 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Stx7O70439 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Stx7O70439 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Stx7O70439 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Stx7O70439 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Stx7O70439 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Stx7O70439 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Stx7O70439 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Stx7O70439 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Stx7O70439 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Stx7O70439 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Stx7O70439 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Stx7O70439 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Stx7O70439 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Stx7O70439 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Stx7O70439 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Stx7O70439 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Stx7O70439 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Stx7O70439 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Stx7O70439 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Stx7O70439 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Stx7O70439 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Stx7O70439 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Stx7O70439 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Stx7O70439 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Stx7O70439 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Stx7O70439 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Stx7O70439 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Stx7O70439 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Stx7O70439 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Stx7O70439 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Stx7O70439 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Stx7O70439 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Stx7O70439 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Stx7O70439 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Stx7O70439 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Stx7O70439 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Stx7O70439 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Stx7O70439 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Stx7O70439 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Stx7O70439 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Stx7O70439 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Stx7O70439 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Stx7O70439 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Stx7O70439 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Stx7O70439 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Stx7O70439 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Stx7O70439 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Stx7O70439 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Stx7O70439 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Stx7O70439 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Stx7O70439 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Stx7O70439 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Stx7O70439 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Stx7O70439 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Stx7O70439 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Stx7O70439 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Stx7O70439 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Stx7O70439 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Stx7O70439 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Stx7O70439 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Stx7O70439 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Stx7O70439 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Stx7O70439 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms