Protein–RNA interactions for Protein: O55236

Rngtt, mRNA-capping enzyme, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RngttO55236 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RngttO55236 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RngttO55236 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RngttO55236 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RngttO55236 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RngttO55236 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RngttO55236 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RngttO55236 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RngttO55236 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
RngttO55236 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
RngttO55236 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RngttO55236 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
RngttO55236 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RngttO55236 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RngttO55236 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RngttO55236 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RngttO55236 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RngttO55236 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RngttO55236 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
RngttO55236 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RngttO55236 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RngttO55236 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RngttO55236 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RngttO55236 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
RngttO55236 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
RngttO55236 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RngttO55236 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RngttO55236 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RngttO55236 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RngttO55236 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RngttO55236 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
RngttO55236 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RngttO55236 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RngttO55236 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RngttO55236 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RngttO55236 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
RngttO55236 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RngttO55236 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RngttO55236 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RngttO55236 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
RngttO55236 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
RngttO55236 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RngttO55236 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
RngttO55236 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
RngttO55236 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RngttO55236 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RngttO55236 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RngttO55236 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RngttO55236 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RngttO55236 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RngttO55236 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RngttO55236 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RngttO55236 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RngttO55236 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RngttO55236 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RngttO55236 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RngttO55236 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RngttO55236 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RngttO55236 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RngttO55236 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RngttO55236 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RngttO55236 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RngttO55236 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RngttO55236 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RngttO55236 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RngttO55236 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RngttO55236 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RngttO55236 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RngttO55236 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RngttO55236 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RngttO55236 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RngttO55236 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RngttO55236 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RngttO55236 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RngttO55236 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RngttO55236 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
RngttO55236 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RngttO55236 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RngttO55236 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RngttO55236 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RngttO55236 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RngttO55236 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RngttO55236 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RngttO55236 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RngttO55236 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RngttO55236 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RngttO55236 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RngttO55236 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RngttO55236 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RngttO55236 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RngttO55236 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RngttO55236 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RngttO55236 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RngttO55236 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RngttO55236 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RngttO55236 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RngttO55236 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RngttO55236 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RngttO55236 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RngttO55236 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms