Protein–RNA interactions for Protein: O54891

Lgals6, Galectin-6, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgals6O54891 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lgals6O54891 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lgals6O54891 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lgals6O54891 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lgals6O54891 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lgals6O54891 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lgals6O54891 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lgals6O54891 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lgals6O54891 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lgals6O54891 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lgals6O54891 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lgals6O54891 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lgals6O54891 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lgals6O54891 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lgals6O54891 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lgals6O54891 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lgals6O54891 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Lgals6O54891 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lgals6O54891 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lgals6O54891 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lgals6O54891 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lgals6O54891 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lgals6O54891 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lgals6O54891 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lgals6O54891 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lgals6O54891 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lgals6O54891 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lgals6O54891 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lgals6O54891 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lgals6O54891 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lgals6O54891 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lgals6O54891 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lgals6O54891 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lgals6O54891 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lgals6O54891 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lgals6O54891 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lgals6O54891 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lgals6O54891 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lgals6O54891 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lgals6O54891 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lgals6O54891 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lgals6O54891 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lgals6O54891 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lgals6O54891 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lgals6O54891 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lgals6O54891 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lgals6O54891 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lgals6O54891 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lgals6O54891 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lgals6O54891 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lgals6O54891 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lgals6O54891 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lgals6O54891 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lgals6O54891 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lgals6O54891 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lgals6O54891 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lgals6O54891 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lgals6O54891 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lgals6O54891 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lgals6O54891 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lgals6O54891 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lgals6O54891 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lgals6O54891 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lgals6O54891 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lgals6O54891 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lgals6O54891 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lgals6O54891 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lgals6O54891 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lgals6O54891 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lgals6O54891 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lgals6O54891 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lgals6O54891 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lgals6O54891 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lgals6O54891 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lgals6O54891 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lgals6O54891 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lgals6O54891 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lgals6O54891 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lgals6O54891 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lgals6O54891 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lgals6O54891 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lgals6O54891 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Lgals6O54891 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lgals6O54891 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lgals6O54891 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lgals6O54891 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lgals6O54891 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lgals6O54891 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lgals6O54891 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lgals6O54891 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lgals6O54891 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lgals6O54891 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lgals6O54891 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lgals6O54891 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lgals6O54891 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lgals6O54891 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lgals6O54891 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lgals6O54891 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lgals6O54891 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lgals6O54891 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms