Protein–RNA interactions for Protein: O35903

Ccl25, C-C motif chemokine 25, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl25O35903 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccl25O35903 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccl25O35903 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccl25O35903 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccl25O35903 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccl25O35903 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccl25O35903 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccl25O35903 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccl25O35903 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccl25O35903 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccl25O35903 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccl25O35903 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccl25O35903 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccl25O35903 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccl25O35903 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccl25O35903 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccl25O35903 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccl25O35903 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccl25O35903 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccl25O35903 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccl25O35903 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccl25O35903 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccl25O35903 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccl25O35903 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccl25O35903 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccl25O35903 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccl25O35903 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccl25O35903 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccl25O35903 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccl25O35903 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccl25O35903 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccl25O35903 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccl25O35903 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccl25O35903 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccl25O35903 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccl25O35903 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccl25O35903 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccl25O35903 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccl25O35903 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccl25O35903 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccl25O35903 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccl25O35903 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Ccl25O35903 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccl25O35903 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccl25O35903 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccl25O35903 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccl25O35903 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccl25O35903 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccl25O35903 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccl25O35903 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccl25O35903 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
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Ccl25O35903 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccl25O35903 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccl25O35903 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccl25O35903 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccl25O35903 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Ccl25O35903 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Ccl25O35903 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccl25O35903 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
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Ccl25O35903 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccl25O35903 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccl25O35903 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccl25O35903 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccl25O35903 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccl25O35903 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Ccl25O35903 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccl25O35903 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccl25O35903 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccl25O35903 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccl25O35903 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccl25O35903 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl25O35903 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl25O35903 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl25O35903 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl25O35903 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl25O35903 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl25O35903 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl25O35903 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl25O35903 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccl25O35903 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccl25O35903 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccl25O35903 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccl25O35903 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccl25O35903 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccl25O35903 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccl25O35903 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Ccl25O35903 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms