Protein–RNA interactions for Protein: O35857

Timm44, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM44, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timm44O35857 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Timm44O35857 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Timm44O35857 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Timm44O35857 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Timm44O35857 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Timm44O35857 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Timm44O35857 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Timm44O35857 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Timm44O35857 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Timm44O35857 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Timm44O35857 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Timm44O35857 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Timm44O35857 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Timm44O35857 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Timm44O35857 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Timm44O35857 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Timm44O35857 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Timm44O35857 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Timm44O35857 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Timm44O35857 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Timm44O35857 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Timm44O35857 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Timm44O35857 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Timm44O35857 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Timm44O35857 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Timm44O35857 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Timm44O35857 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Timm44O35857 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Timm44O35857 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Timm44O35857 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Timm44O35857 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Timm44O35857 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Timm44O35857 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Timm44O35857 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Timm44O35857 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Timm44O35857 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Timm44O35857 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Timm44O35857 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Timm44O35857 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Timm44O35857 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Timm44O35857 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Timm44O35857 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Timm44O35857 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Timm44O35857 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Timm44O35857 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Timm44O35857 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Timm44O35857 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Timm44O35857 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Timm44O35857 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Timm44O35857 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Timm44O35857 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Timm44O35857 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Timm44O35857 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Timm44O35857 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Timm44O35857 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Timm44O35857 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Timm44O35857 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Timm44O35857 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Timm44O35857 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Timm44O35857 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Timm44O35857 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Timm44O35857 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Timm44O35857 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Timm44O35857 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Timm44O35857 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Timm44O35857 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Timm44O35857 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Timm44O35857 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Timm44O35857 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Timm44O35857 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Timm44O35857 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Timm44O35857 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Timm44O35857 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Timm44O35857 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Timm44O35857 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Timm44O35857 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Timm44O35857 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Timm44O35857 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Timm44O35857 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Timm44O35857 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Timm44O35857 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Timm44O35857 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Timm44O35857 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Timm44O35857 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Timm44O35857 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Timm44O35857 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Timm44O35857 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Timm44O35857 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Timm44O35857 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Timm44O35857 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Timm44O35857 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Timm44O35857 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Timm44O35857 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Timm44O35857 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Timm44O35857 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Timm44O35857 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Timm44O35857 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Timm44O35857 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Timm44O35857 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Timm44O35857 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms