Protein–RNA interactions for Protein: O35452

Tnxb, Tenascin X, mousemouse

Predictions only

Length 4,006 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnxbO35452 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TnxbO35452 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TnxbO35452 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TnxbO35452 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TnxbO35452 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TnxbO35452 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TnxbO35452 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TnxbO35452 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TnxbO35452 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TnxbO35452 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TnxbO35452 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TnxbO35452 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TnxbO35452 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TnxbO35452 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TnxbO35452 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TnxbO35452 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TnxbO35452 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TnxbO35452 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TnxbO35452 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TnxbO35452 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TnxbO35452 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TnxbO35452 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TnxbO35452 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TnxbO35452 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TnxbO35452 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TnxbO35452 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TnxbO35452 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TnxbO35452 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TnxbO35452 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TnxbO35452 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TnxbO35452 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TnxbO35452 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TnxbO35452 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TnxbO35452 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TnxbO35452 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TnxbO35452 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TnxbO35452 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TnxbO35452 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TnxbO35452 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TnxbO35452 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TnxbO35452 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
TnxbO35452 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TnxbO35452 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TnxbO35452 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TnxbO35452 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TnxbO35452 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TnxbO35452 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TnxbO35452 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TnxbO35452 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TnxbO35452 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TnxbO35452 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TnxbO35452 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TnxbO35452 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TnxbO35452 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TnxbO35452 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TnxbO35452 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TnxbO35452 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TnxbO35452 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TnxbO35452 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TnxbO35452 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TnxbO35452 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TnxbO35452 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TnxbO35452 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TnxbO35452 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TnxbO35452 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TnxbO35452 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TnxbO35452 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TnxbO35452 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TnxbO35452 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TnxbO35452 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TnxbO35452 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TnxbO35452 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TnxbO35452 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TnxbO35452 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
TnxbO35452 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TnxbO35452 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TnxbO35452 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TnxbO35452 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TnxbO35452 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TnxbO35452 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TnxbO35452 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TnxbO35452 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TnxbO35452 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TnxbO35452 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TnxbO35452 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TnxbO35452 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TnxbO35452 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TnxbO35452 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TnxbO35452 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TnxbO35452 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TnxbO35452 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TnxbO35452 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TnxbO35452 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TnxbO35452 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TnxbO35452 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TnxbO35452 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TnxbO35452 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TnxbO35452 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TnxbO35452 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TnxbO35452 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.7 ms