Protein–RNA interactions for Protein: O35392

Foxd2, Forkhead box protein D2, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd2O35392 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Foxd2O35392 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Foxd2O35392 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Foxd2O35392 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Foxd2O35392 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Foxd2O35392 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Foxd2O35392 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Foxd2O35392 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Foxd2O35392 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Foxd2O35392 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Foxd2O35392 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Foxd2O35392 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Foxd2O35392 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Foxd2O35392 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Foxd2O35392 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Foxd2O35392 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Foxd2O35392 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Foxd2O35392 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Foxd2O35392 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Foxd2O35392 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Foxd2O35392 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Foxd2O35392 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Foxd2O35392 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Foxd2O35392 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Foxd2O35392 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Foxd2O35392 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Foxd2O35392 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Foxd2O35392 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Foxd2O35392 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Foxd2O35392 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Foxd2O35392 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Foxd2O35392 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Foxd2O35392 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Foxd2O35392 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Foxd2O35392 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Foxd2O35392 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Foxd2O35392 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Foxd2O35392 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Foxd2O35392 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Foxd2O35392 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Foxd2O35392 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Foxd2O35392 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Foxd2O35392 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Foxd2O35392 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Foxd2O35392 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Foxd2O35392 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Foxd2O35392 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Foxd2O35392 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Foxd2O35392 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Foxd2O35392 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Foxd2O35392 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Foxd2O35392 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Foxd2O35392 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Foxd2O35392 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Foxd2O35392 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Foxd2O35392 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Foxd2O35392 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Foxd2O35392 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Foxd2O35392 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Foxd2O35392 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Foxd2O35392 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Foxd2O35392 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Foxd2O35392 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Foxd2O35392 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Foxd2O35392 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Foxd2O35392 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Foxd2O35392 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Foxd2O35392 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Foxd2O35392 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Foxd2O35392 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Foxd2O35392 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Foxd2O35392 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Foxd2O35392 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Foxd2O35392 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Foxd2O35392 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Foxd2O35392 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Foxd2O35392 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Foxd2O35392 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Foxd2O35392 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Foxd2O35392 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Foxd2O35392 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Foxd2O35392 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Foxd2O35392 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Foxd2O35392 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Foxd2O35392 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Foxd2O35392 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Foxd2O35392 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Foxd2O35392 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Foxd2O35392 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Foxd2O35392 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Foxd2O35392 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Foxd2O35392 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Foxd2O35392 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Foxd2O35392 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Foxd2O35392 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Foxd2O35392 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Foxd2O35392 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Foxd2O35392 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Foxd2O35392 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Foxd2O35392 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms