Protein–RNA interactions for Protein: O35348

Colq, Acetylcholinesterase collagenic tail peptide, mousemouse

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Length 457 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ColqO35348 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ColqO35348 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ColqO35348 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ColqO35348 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ColqO35348 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ColqO35348 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ColqO35348 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ColqO35348 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ColqO35348 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ColqO35348 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ColqO35348 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ColqO35348 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ColqO35348 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ColqO35348 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ColqO35348 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ColqO35348 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ColqO35348 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ColqO35348 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ColqO35348 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ColqO35348 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ColqO35348 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ColqO35348 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ColqO35348 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ColqO35348 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ColqO35348 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ColqO35348 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ColqO35348 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ColqO35348 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ColqO35348 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ColqO35348 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ColqO35348 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ColqO35348 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ColqO35348 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ColqO35348 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ColqO35348 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ColqO35348 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ColqO35348 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ColqO35348 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ColqO35348 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ColqO35348 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ColqO35348 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ColqO35348 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ColqO35348 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ColqO35348 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ColqO35348 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ColqO35348 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ColqO35348 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ColqO35348 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ColqO35348 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ColqO35348 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ColqO35348 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ColqO35348 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ColqO35348 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ColqO35348 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ColqO35348 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ColqO35348 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ColqO35348 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ColqO35348 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ColqO35348 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ColqO35348 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ColqO35348 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ColqO35348 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ColqO35348 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ColqO35348 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ColqO35348 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ColqO35348 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ColqO35348 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ColqO35348 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ColqO35348 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ColqO35348 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ColqO35348 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ColqO35348 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ColqO35348 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ColqO35348 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ColqO35348 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ColqO35348 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ColqO35348 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ColqO35348 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ColqO35348 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ColqO35348 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ColqO35348 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ColqO35348 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ColqO35348 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ColqO35348 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ColqO35348 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ColqO35348 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ColqO35348 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ColqO35348 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ColqO35348 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ColqO35348 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ColqO35348 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ColqO35348 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ColqO35348 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ColqO35348 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ColqO35348 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ColqO35348 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ColqO35348 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ColqO35348 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ColqO35348 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ColqO35348 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
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